Utafiti wa kitaaluma, lugha inayoeleweka

Verianla | Akademik Araştırmalardan Türkçe Ekonomi ve Bilim İçerikleri

27 Septemba 2026, Jumapili
VERİANLAUchapishaji huru wa sayansi
Fungua au funga menyu
...
Home / Sayansi za Afya / Utafiti wa Kitiba / Alama ya Kinga Ndani ya Jicho katika Shambulio la Kufungwa kwa Pembe Kali Linaloambatana na COVID-19: Mhimili wa STAT1–ISG15–MX1–IFIT1/3
Utafiti wa Kitiba

Alama ya Kinga Ndani ya Jicho katika Shambulio la Kufungwa kwa Pembe Kali Linaloambatana na COVID-19: Mhimili wa STAT1–ISG15–MX1–IFIT1/3

Shambulio la kufungwa kwa pembe kali ni dharura ya macho ambapo shinikizo ndani ya jicho huongezeka haraka huku pembe ya chumba cha mbele inayoruhusu majimaji ya ndani ya jicho kutoka ikifungwa.

25/07/2026  Veri Anla Imetazamwa mara 37
Alama ya Kinga Ndani ya Jicho katika Shambulio la Kufungwa kwa Pembe Kali Linaloambatana na COVID-19: Mhimili wa STAT1–ISG15–MX1–IFIT1/3

Shambulio la kufungwa kwa pembe kali ni dharura ya macho ambapo shinikizo ndani ya jicho huongezeka haraka huku pembe ya chumba cha mbele inayoruhusu majimaji ya ndani ya jicho kutoka ikifungwa. Kwa wagonjwa waliochunguzwa kulikuwa na shinikizo kubwa ndani ya jicho, maumivu ya jicho na kuharibika kwa kuona; chumba cha mbele kifupi, pembe iliyofungwa na kujitokeza mbele kwa iris ya pembeni vilithibitishwa kwa biomicroscopy, gonioscopy na ultrasound biomicroscopy.

Juan Zheng na wenzake walichunguza iwapo muundo wa protini katika aqueous humor ya chumba cha mbele cha jicho hubadilika kwa wagonjwa ambao maambukizi ya COVID-19 yanaambatana na hali hii ya kliniki. Utafiti ulihusisha wagonjwa 16 waliowasilisha Liaocheng People’s Hospital kati ya Januari–Oktoba 2023. Wagonjwa wanane walikuwa na shambulio la kufungwa kwa pembe kali pamoja na maambukizi ya COVID-19 kwa wakati mmoja, huku wagonjwa wengine wanane wakiwa na shambulio la kufungwa kwa pembe kali bila COVID-19.

Takribani 100 µL ya aqueous humor ilichukuliwa kutoka kwa kila mgonjwa na sampuli zikahifadhiwa katika –80 °C. Baada ya protini kuvunjwa kuwa peptidi kwa tripsini, zilichunguzwa kwa mass spectrometry ya data-independent acquisition inayoitwa 4D-DIA katika utafiti. Kazi za protini zilitathminiwa kwa hifadhidata za GO, KEGG, Reactome na WikiPathways; mahusiano kati ya protini yakatathminiwa kwa mtandao wa mwingiliano wa protini-protini wa STRING.

Watafiti walitambua jumla ya protini 4.588 katika aqueous humor. Katika sehemu kuu ya matokeo iliripotiwa kuwa protini 82 ziliongezeka, protini 121 zilipungua na protini 3.743 hazikubadilika kwa namna tofauti katika kundi la COVID-19–AACC. Hasa, protini tano zinazochochewa na interferoni ziliongezeka pamoja katika kundi la COVID-19–AACC:

ProtiniFold-change iliyoripotiwaThamani ya P iliyoripotiwaKazi iliyoangaziwa katika utafiti
STAT11,7520,0207Mdhibiti mkuu wa unukuzi anayebadilisha ishara za interferoni kuwa usemi wa jeni ndani ya kiini
ISG153,2470,00062Protini inayofanana na ubiquitin inayodhibiti kazi na uthabiti wa protini kupitia ISGylation
MX12,5980,00186GTPase ya kuzuia virusi inayoweza kuzuia kompleksi za kujizalisha kwa virusi na michakato ya nucleocapsid
IFIT13,3520,00466Efekta inayotambua miundo fulani ya RNA ya virusi na kukandamiza usanisi wa protini za virusi
IFIT31,8790,0499Protini ya kiunzi inayosaidia IFIT1 na kuimarisha ishara ya kuzuia virusi

Mtandao wa mwingiliano wa protini ulionyesha kuwa protini hizi tano huunda moduli ya kuzuia virusi iliyounganishwa. Mfuatano uliopendekezwa na watafiti ni: kuhamishwa kwa ishara ya interferoni kupitia STAT1 hadi kwenye usemi wa jeni, utekelezaji wa athari ya kuzuia virusi kwa MX1 na IFIT1/IFIT3, na udhibiti wa protini baada ya tafsiri kupitia ISG15.

Katika uchanganuzi wa njia, ishara ya vipokezi vinavyofanana na RIG-I, mwitikio wa interferoni alfa/beta, taratibu za kuzuia virusi za jeni zinazochochewa na interferoni, mfumo wa ISG15, ribosomu na usanisi wa protini, uchakataji wa RNA, kimetaboliki ya nishati, mkazo wa kioksidishaji, urekebishaji wa DNA, necroptosis, cytoskeleton ya actin, phagocytosis na ishara za mishipa zilijitokeza.

Matokeo ya utafiti yanaonyesha kuwa kuna alama dhahiri ya interferoni na protini za kuzuia virusi katika majimaji ya ndani ya jicho ya wagonjwa wenye kufungwa kwa pembe kali pamoja na maambukizi ya COVID-19. Hata hivyo, utafiti hauthibitishi kwamba COVID-19 husababisha moja kwa moja kufungwa kwa pembe kali, kwamba protini hizi ndizo chanzo cha ugonjwa, au kwamba matibabu yanayolenga protini hizi yanafaa na ni salama.

Sampuli ina wagonjwa 16 tu, hakuna jaribio huru la uthibitishaji, na kuna kutokuwiana muhimu katika uripoti wa takwimu. Kwa hiyo, matokeo yanapaswa kuchukuliwa kama wagombea wa kimolekuli wanaohitaji kupimwa katika tafiti kubwa na za vituo vingi, badala ya viashirio vya kibaolojia vilivyo tayari kwa matumizi ya kliniki.

Shambulio la kufungwa kwa pembe kali ni nini?

Mzunguko na utokaji wa aqueous humor inayozalishwa daima katika chumba cha mbele cha jicho una jukumu la msingi katika udhibiti wa shinikizo ndani ya jicho. Ikiwa pembe ya chumba cha mbele kati ya iris na konea inafungwa, utokaji wa majimaji unaweza kuzuiliwa sana. Matokeo yake, shinikizo ndani ya jicho linaweza kupanda kwa muda mfupi.

Wagonjwa wote walioingizwa kwenye utafiti walikuwa na shinikizo kubwa ndani ya jicho, maumivu ya jicho na kupungua kwa kuona katika kipindi cha papo hapo. Tathmini ya kliniki ilibaini chumba cha mbele kifupi, kufungwa kwa pembe na kujitokeza mbele kwa iris ya pembeni. Historia za kitabibu pia ziliandikisha iwapo kulikuwa na malalamiko kama maumivu ya kichwa, kichefuchefu, kutapika, kuona kwa ukungu kwa muda na kuona duara za mwanga kuzunguka taa.

Utafiti huu si utafiti wa epidemiolojia unaolenga kubaini sababu za jumla za kufungwa kwa pembe kali. Washiriki wote tayari walikuwa na shambulio la kufungwa kwa pembe kali. Tofauti inayochunguzwa ni kati ya wasifu wa protini za aqueous humor kwa wagonjwa wa AACC wenye na wasio na maambukizi ya COVID-19.

Kwa nini utafiti unalenga COVID-19?

Makala inaangazia mkusanyiko wa visa vya kufungwa kwa pembe kali katika kipindi cha janga na baadhi ya uchunguzi wa kliniki uliojitokeza muda mfupi baada ya maambukizi ya SARS-CoV-2. Maelezo yanayowezekana yaliyopendekezwa ni pamoja na uchochezi wa mfumo mzima wa mwili, mabadiliko ya mfumo wa neva wa kujiendesha, matatizo ya endocrine na usingizi, mabadiliko katika matumizi ya dawa, mwitikio wa mishipa na mabadiliko ya uchochezi katika miundo ya utokaji wa majimaji ya ndani ya jicho.

Watafiti wanapendekeza kuwa mwitikio wa kinga unaohusiana na SARS-CoV-2 unaweza kupunguza ukingo wa usalama wa utokaji wa aqueous humor katika jicho ambalo tayari lina hatari ya kianatomia. Hata hivyo, wazo hili ni nadharia ya mwanzo ya utafiti; utafiti wenyewe hauonyeshi moja kwa moja kwamba pembe ya jicho ilifungwa kwa sababu ya COVID-19.

Pengo katika fasihi

Katika tafiti za proteomics za COVID-19, complement, kuganda kwa damu, cytokines na njia za interferoni zimechunguzwa katika plasma ya damu, seli za mononuclear za damu ya pembeni na makundi mbalimbali ya seli. Kinyume chake, inaelezwa kuwa data ya kimfumo kuhusu jinsi maambukizi ya COVID-19 yanavyoathiri mazingira ya protini katika chumba cha mbele cha jicho wakati wa kufungwa kwa pembe kali ni ndogo.

Maswali makuu ya utafiti ni haya:

  • Je, kuna saini tofauti ya protini katika aqueous humor ya wagonjwa wa AACC wenye maambukizi ya COVID-19?
  • Je, protini zinazochochewa na interferoni huongezeka pamoja?
  • Je, STAT1, ISG15, MX1, IFIT1 na IFIT3 huunda mhimili wa udhibiti uliounganishwa kikazi?
  • Je, mabadiliko ya protini yanahusiana na kimetaboliki, usanisi wa protini, kifo cha seli, cytoskeleton na kazi za mishipa zaidi ya mwitikio wa kuzuia virusi?
  • Je, protini hizi zinaweza kuwa wagombea wa viashirio vya kibaolojia au utafiti wa matibabu siku zijazo?

Makundi ya wagonjwa

Utafiti ulifanywa katika kituo kimoja kati ya Januari 2023 na Oktoba 2023. Wagonjwa waliotathminiwa ni wale waliohitaji anterior chamber paracentesis ili kupunguza shinikizo ndani ya jicho kutokana na kufungwa kwa pembe kali, au ambao walihitaji majimaji kutolewa wakati wa upasuaji.

SifaKundi la COVID-19–AACCKundi la udhibiti la AACC
Idadi ya wagonjwa na machoWagonjwa 8, macho 8Wagonjwa 8, macho 8
UmriMiaka 69,21 ± 7,74Miaka 65,36 ± 5,83
JinsiaWanaume 3, wanawake 5Wanaume 2, wanawake 6
Shinikizo ndani ya jicho46,56 ± 9,37 mmHg42,81 ± 11,50 mmHg
Urefu wa axial22,01 ± 1,67 mm21,86 ± 1,34 mm
Kina cha chumba cha mbele2,21 ± 0,46 mm2,33 ± 0,38 mm
Unene wa lenzi5,23 ± 0,32 mm5,30 ± 0,28 mm
KisukariWagonjwa 2Mgonjwa 1
Shinikizo la damuWagonjwa 3Wagonjwa 2

Maandishi makuu yanasema hakukuwa na tofauti yenye maana kati ya makundi mawili katika demografia ya mwanzo na sifa za kliniki, na kwamba P>0,05 ilipatikana kwa ulinganisho wote. Hata hivyo, Jedwali 1 halionyeshi thamani za P za kila kigezo au vipimo vilivyotumika. Katika makundi ya watu wanane, “kutokuwepo kwa tofauti yenye maana” hakuthibitishi kuwa makundi yanafanana kikamilifu; tofauti halisi zinaweza kuwa hazikugunduliwa kwa sababu ya nguvu ndogo ya takwimu.

Hali ya COVID-19 iliandikwaje?

Timu ya utafiti inaripoti kuwa iliandika matokeo ya kipimo cha nucleic acid au antigen, tarehe ya maambukizi, dalili za kliniki na matibabu yaliyotolewa. Katika kundi la COVID-19–AACC, uchovu, homa ya kiwango cha chini na dalili za njia ya juu ya hewa ziliripotiwa.

Hata hivyo, njia ya kipimo kwa kila mgonjwa, muda kati ya maambukizi na kuanza kwa shambulio la jicho, ukali wa COVID-19, hali ya chanjo, aina ya virusi, matibabu ya kuzuia virusi au corticosteroid, na kiwango cha uchochezi wa mfumo mzima wa mwili havikuonyeshwa katika majedwali ya matokeo. Vigezo hivi ni viingiliaji vinavyoweza kuathiri wasifu wa protini ndani ya jicho.

Uchunguzi wa macho uliosanifishwa

Washiriki walifanyiwa uchunguzi mpana wa macho katika kipindi cha baada ya kuwasilisha kilichochukuliwa kuwa kinachoweza kulinganishwa:

  • Kupima shinikizo ndani ya jicho kwa rebound tonometer katika macho yote mawili,
  • Kurekodi shinikizo la mwanzo katika jicho lililoathirika papo hapo kabla ya matibabu ya kupunguza shinikizo,
  • Biomicroscopy ya slit-lamp kwa konea, chumba cha mbele, iris na lenzi,
  • Uchunguzi wa fundus kwa optic disc na macula,
  • Gonioscopy kwa lenzi ya aina ya Goldmann,
  • Kupima urefu wa axial,
  • Kipimo cha uwanja wa kuona kwa Humphrey automated perimetry,
  • Ultrasound biomicroscopy kutathmini pembe, iris ya pembeni, mwili wa ciliary na nafasi ya lenzi.

Imeelezwa kuwa uchunguzi ulifanywa na madaktari bingwa wa macho na data ikakaguliwa kwa kujitegemea na wataalamu wawili. Hata hivyo, haijaelezwa kama wakaguzi walikuwa wamefichwa taarifa za kundi la COVID-19.

Sampuli za aqueous humor zilichukuliwaje?

Sampuli zilichukuliwa katika mazingira ya chumba cha upasuaji wakati wa anterior chamber paracentesis. Ili kuzuia maambukizi, matone ya levofloxacin yalitolewa kabla ya upasuaji; siku ya utaratibu uso wa jicho uliandaliwa na anesthesia ya juu kwa oxybuprocaine hydrochloride ilitumika.

Daktari mmoja wa upasuaji mwenye uzoefu aliingiza sindano ya insulini ya 1 mL kupitia eneo la limbus ya konea iliyo wazi hadi chumba cha mbele chini ya darubini. Takribani 100 µL ya aqueous humor ilivutwa kwa shinikizo hasi la chini kwa uangalifu ili kutogusa iris, lenzi na endothelium ya konea. Sampuli ziliwekwa katika mirija tasa ya microcentrifuge.

Sampuli ziliwekwa kwanza juu ya barafu, kisha zikahifadhiwa katika –80 °C hadi uchunguzi wa proteomics. Ilielezwa kuwa sampuli zenye uchafu wa damu unaoonekana au ukungu zingeondolewa. Baada ya kuchukua sampuli, taratibu kama trabeculectomy au phacoemulsification ziliendelea kulingana na hitaji la kliniki.

Uchanganuzi wa proteomics ulifanywaje?

Sampuli za aqueous humor zilizogandishwa ziliyeyushwa juu ya barafu, zikazungushwa kwa centrifuge ili kutenganisha chembe na supernatant ikachukuliwa. Ili kusawazisha jumla ya protini kati ya sampuli, loading normalization ilifanywa kulingana na mkusanyiko wa protini.

Protini zilidenature, vifungo vya disulfide vikapunguzwa na vikundi huru vya sulfhydryl vikafanyiwa alkylation. Kisha digestion ya kienzymu kwa tripsini ilifanywa; peptidi zilizotokana zikasafishwa kwa solid-phase extraction na kisha lyophilized.

Peptidi ziliingizwa kwenye mfumo wa high-performance liquid chromatography–mass spectrometry na kuchanganuliwa katika data-independent acquisition mode. Sampuli za udhibiti wa ubora zilitumika katika utafiti mzima kufuatilia uthabiti wa kifaa.

Katika data ghafi, peak extraction, ion matching, utambuzi wa peptidi na ukadiriaji wa protini ulifanywa. Ilielezwa kuwa false discovery rate katika ngazi ya peptidi na protini iliwekwa chini ya asilimia 1:

\[ \mathrm{FDR}_{peptit} < 0{,}01 \]

\[ \mathrm{FDR}_{protein} < 0{,}01 \]

Data ilipitia uongofu wa logarithmic, kujaza thamani zilizokosekana na normalization. Hata hivyo, modeli ya kifaa, vigezo vya ion mobility, safu ya chromatography, gradient, masafa ya mass, madirisha ya DIA, collision energies, uwiano wa tripsini/protini, programu iliyotumika, toleo, hifadhidata ya proteome ya binadamu, njia ya kujaza thamani zilizokosekana na algorithm ya normalization havikutolewa katika PDF.

Upungufu huu unafanya iwe vigumu kurudia njia ileile katika maabara nyingine. Aidha, ingawa neno “4D-DIA” limetumika katika muhtasari na kichwa, haijaelezwa kwa kina ni kifaa gani na mbinu gani ya ion mobility iliyotumika kufanya uchanganuzi wa vipimo vinne.

Kizingiti cha protini tofauti

Katika sehemu ya matokeo imeandikwa kuwa kwa protini tofauti, fold-change lazima iwe zaidi ya 1,5 na thamani ya P katika two-tailed Student t-test iwe chini ya 0,05:

\[ FC > 1{,}5 \]

\[ p < 0{,}05 \]

Kwa ujumla fold-change inaonyesha uwiano wa wastani wa wingi wa protini kati ya makundi mawili:

\[ FC = \frac{\text{COVID-19–AACC grubundaki ortalama protein bolluğu}}{\text{AACC kontrol grubundaki ortalama protein bolluğu}} \]

Mlinganyo huu umeongezwa ili kueleza uwiano katika majedwali; haukutolewa katika PDF kama mlinganyo wa kihisabati ulio wazi. Katika majedwali, ulinganisho umeonyeshwa kama “AH:AHC”, lakini vifupisho AH na AHC havijafafanuliwa wazi katika sehemu ya mbinu. Maandishi na grafu za protini msingi zinaashiria kuwa kundi la AH linawakilisha upande wa COVID-19–AACC.

Katika sehemu ya mbinu pia imeelezwa kuwa q<0,05 ingetumika baada ya marekebisho ya multiple testing. Hata hivyo, katika matokeo kunatajwa thamani ghafi ya P na majedwali yanaonyesha safu ya P. Haijaelezwa kama thamani za P ni zilizorekebishwa.

Kwa nini ulinganisho mwingi ni muhimu katika maelfu ya vipimo?

Wakati maelfu ya protini yanalinganishwa kwa wakati mmoja, thamani ndogo za P zinaweza kupatikana kwa bahati hata kama hakuna tofauti halisi kati ya makundi. Kwa sababu hii, false discovery rate au marekebisho mengine ya ulinganisho mwingi ni muhimu sana katika tafiti za proteomics.

Utafiti unasema kuwa marekebisho ya multiple testing yalifanywa, lakini uainishaji katika majedwali ya matokeo hauoani wazi na kanuni hii. Kwa mfano, kwenye jedwali la protini zilizoongezeka, DPYSL4 ina P=0,08298, LCP1 ina P=0,10490 na CRMP1 ina P=0,13038. Vivyo hivyo, kuna mistari mingi yenye P>0,05 katika jedwali la protini zilizopungua.

Kinyume chake, katika Jedwali la Ziada S1 lililoelezwa kuwa “halina umuhimu wa kitakwimu”, PPP1R12A ina FC=0,557942 na P=0,049883. Kwa hiyo, haiwezekani kuamua kwa uhakika ni protini zipi zina umuhimu wa kitakwimu uliorekebishwa kwa kutegemea tu vichwa vya majedwali.

Matokeo ya udhibiti wa ubora

Sehemu ya juu ya Kielelezo 1 inaonyesha idadi ya peptidi na protini zilizotambuliwa kwa kila sampuli. Idadi ya peptidi kwa sampuli ni takribani 29.909 hadi 54.325; idadi ya protini ni takribani 3.265 hadi 4.405.

Vilevile imeonyeshwa kuwa:

  • Jumla ya protini 4.588 zilitambuliwa,
  • Protini 4.342 zilipimwa katika angalau asilimia 25 ya sampuli,
  • Protini 3.946 zilipimwa katika angalau asilimia 50 ya sampuli,
  • Protini 2.450 zilipimwa katika sampuli zote.

Sehemu ya chini ina usambazaji limbikizi wa coefficient of variation na box plots kwa protini zilizofanyiwa normalization. Usambazaji wa variation wa makundi mawili haufanani kabisa. Kwa ujumla maandishi yanahitimisha kuwa uthabiti wa kifaa na reproducibility vilitosha.

Maandishi makuu yanasema total ion chromatograms zilifunikana vizuri, maumbo ya peaks yalikuwa mazuri, retention time drift ilikuwa ndogo na sampuli za udhibiti wa ubora zilikusanyika pamoja katika PCA. Hata hivyo, PDF haionyeshi picha za TIC au PCA zinazolingana na madai haya.

Protini ngapi zilibadilika?

Kulingana na sehemu ya matokeo, kati ya protini 4.588 zilizotambuliwa:

  • 82 ziliongezeka katika kundi la COVID-19–AACC,
  • 121 zilipungua,
  • 3.743 hazikuonyesha tofauti yenye maana.

Jumla ya namba hizi tatu ni 3.946. Kielelezo 1 pia kinaonyesha kwamba protini 3.946 zilipimwa katika angalau asilimia 50 ya sampuli. Usawa huu unaashiria kwamba differential analysis huenda ulifanywa tu kwa protini hizi 3.946. Inaweza kudhaniwa kwamba protini 642 zilizobaki zilitengwa kwa sababu ya kiwango cha juu cha vipimo vilivyokosekana; lakini maandishi hayafafanui wazi ulimwengu huu wa uchanganuzi.

Katika volcano plot ya Kielelezo 2, mhimili mlalo umeonyeshwa kama \( \log_2(AH/AHC) \), na mhimili wima kama \(-\log_{10}(P)\):

\[ \log_2(FC) > 0 \Rightarrow \text{COVID-19 yönünde daha yüksek protein bolluğu} \]

\[ \log_2(FC) < 0 \Rightarrow \text{kontrol yönünde daha yüksek protein bolluğu} \]

Katika grafu, ISG15, MX1 na IFIT1 ni miongoni mwa protini zilizoandikwa upande chanya. Hata hivyo, katika sehemu ya mjadala ya utafiti, jumla ya protini tofauti imetolewa kama 132 badala ya 203. Tofauti hii ya namba haijaelezwa.

Mabadiliko makubwa hayakuwa yamezuiliwa kwa protini tano msingi pekee

STAT1, ISG15, MX1, IFIT1 na IFIT3 ziliwekwa katikati ya utafiti kwa sababu ya uhusiano wao wa kibaolojia na miunganisho katika mtandao wa mwingiliano wa protini. Hata hivyo, fold-change kubwa zaidi katika jedwali hazikuwa zote za mhimili huu.

Kwa mfano, fold-change ya takribani 139,5 iliripotiwa kwa CRYAA; 7,30 kwa APOBEC3A; 4,37 kwa TPST1; na takribani 4,35 kwa LCN1 na SNCB. Baadhi ya protini hizi hazijajadiliwa kwa kina katika mjadala mkuu. Pia kwa kuwa haijaelezwa ni kipimo gani cha centrality, threshold au score kilitumika kuchagua “hub protein” katika STRING, msingi wa kiasi wa uteuzi wa protini tano msingi hauwezi kujengwa upya kikamilifu.

STAT1: Kitovu kinachopeleka ishara kwenye usemi wa jeni

STAT1 ni mojawapo ya transcription factors kuu za njia ya JAK–STAT zinazohamisha ishara kutoka kwa interferoni za aina I, II na III pamoja na cytokines mbalimbali hadi kwenye programu za usemi wa jeni ndani ya kiini cha seli.

Utafiti uliripoti ongezeko la takribani mara 1,75 kwa STAT1. Watafiti wanatafsiri ongezeko hili kama ishara kwamba programu ya jeni ya mwitikio wa interferoni imewashwa katika mazingira ya ndani ya jicho.

Kuongezeka kwa STAT1 pekee hakumaanishi kwamba inasababisha kufungwa kwa pembe kali. Wingi wa protini si sawa na uamilishaji wa kiutendaji; taratibu kama phosphorylation, kuingia kwenye kiini na kufunga jeni lengwa hazikupimwa moja kwa moja.

ISG15: Mdhibiti kati ya ulinzi wa kuzuia virusi na uchochezi

ISG15 ni protini inayofanana na ubiquitin na inayoweza kuunganishwa kwa covalent na protini lengwa. Mchakato huu unaoitwa ISGylation unaweza kubadilisha uthabiti, eneo ndani ya seli na kazi ya protini.

Katika utafiti, ISG15 iliongezeka takribani mara 3,25. Waandishi wanaeleza kwamba ISG15 inaweza kuathiri nguvu na muda wa mwitikio kwa kudhibiti vipengele vya kuzuia virusi kama STAT1, MX1 na protini za IFIT.

Kwa kuwa ISG15 pia inaweza kutolewa nje ya seli na kubadilisha mwitikio wa kinga, hali hii inaashiria jukumu la pande mbili ambapo ulinzi wa kuzuia virusi unaweza kuambatana na uchochezi uliopitiliza. Utafiti haukupima moja kwa moja ni athari ipi kati ya hizi mbili inayotawala.

MX1: Efekta dhidi ya kujizalisha kwa virusi

MX1 ni GTPase kubwa inayochochewa na interferoni. Makala inaeleza kuwa inaweza kupunguza kujizalisha kwa virusi vya RNA kwa kuvuruga mwendo wa nucleocapsid ya virusi, uundaji wa replication complex au mienendo ya membrane ndani ya seli.

Katika kundi la COVID-19–AACC, ongezeko la takribani mara 2,60 liliripotiwa kwa MX1. Ongezeko hili linaashiria kuimarika kwa mwitikio wa efekta wa kuzuia virusi katika mazingira ya ndani ya jicho. Hata hivyo, kwa kuwa RNA ya SARS-CoV-2 au virusi hai haikutafutwa katika aqueous humor, ongezeko la MX1 si ushahidi wa kujizalisha kwa virusi ndani ya jicho.

IFIT1 na IFIT3: Ushirikiano unaozuia usomaji wa RNA ya virusi

IFIT1 inaweza kufunga molekuli fulani za RNA za virusi zisizo na miundo maalumu ya cap na kuzuia kutumika kwao katika usanisi wa protini. Katika utafiti, IFIT1 iliongezeka takribani mara 3,35.

IFIT3 hufanya kazi kama kiunzi na kiongeza ishara katika familia ya IFIT. Inaweza kuunda complex na IFIT1 na kuunganishwa na njia za utambuzi wa nucleic acid kama RIG-I/MDA5–TBK1–IRF3. Ongezeko la takribani mara 1,88 liliripotiwa kwa IFIT3.

Kuongezeka pamoja kwa protini hizi mbili kulitafsiriwa na waandishi si tu kama kuanza kwa ishara ya interferoni, bali pia kama kuimarika kwa ukandamizaji wa tafsiri ya kuzuia virusi.

Mhimili wa kuzuia virusi uliopendekezwa

Mtiririko wa kibaolojia uliopendekezwa na utafiti unaweza kufupishwa kama ifuatavyo:

\[ \text{Viral nükleik asit algısı} \rightarrow \text{interferon üretimi} \rightarrow \text{JAK–STAT/STAT1 etkinliği} \rightarrow \text{ISG genlerinin artışı} \]

\[ \text{STAT1} \rightarrow \text{MX1 ve IFIT1/IFIT3 ile antiviral efektör yanıt} \]

\[ \text{ISG15} \rightarrow \text{ISGylasyon ve protein işlevlerinin translasyon sonrası düzenlenmesi} \]

Michoro hii imetayarishwa ili kueleza simulizi ya kimekanistiki ya utafiti. Mfuatano wa muda wa matukio haya, mwelekeo wao ndani ya seli au uhusiano wa kisababishi haukufuatiliwa kimajaribio.

Mtandao wa mwingiliano wa protini unaonyesha nini?

Kielelezo 3F kinaonyesha miunganisho ya STAT1, ISG15, MX1, IFIT1 na IFIT3 katika hifadhidata ya STRING. Katika mtandao, protini zote tano zimeunganishwa kwa karibu. Mistari ya rangi tofauti inawakilisha vyanzo tofauti vya mahusiano ya STRING kama data za majaribio, rekodi za hifadhidata, text mining, co-expression na vingine.

Mtandao huu hauthibitishi moja kwa moja kwamba protini zinafungamana kimwili katika aqueous humor ya wagonjwa. STRING huonyesha mahusiano ya kiutendaji yanayowezekana yaliyotokana na maarifa ya kibaolojia yaliyopo. Ugunduzi asilia wa utafiti ni kwamba protini hizi zimeongezeka katika kundi lilelile la wagonjwa; mtandao unaonyesha ulinganifu wa ongezeko hilo na mahusiano ya kibaolojia yanayojulikana.

Uchanganuzi wa GO: Protini zinalimbikiza wapi na katika kazi zipi?

Kielelezo 4A kinaonyesha Gene Ontology enrichment katika sehemu tatu.

Vipengele vya seli

Protini tofauti zilijitokeza hasa katika miundo ifuatayo:

  • Cytosol,
  • Vesicles za nje ya seli na exosomes,
  • Ribonucleoprotein complexes,
  • Ribosomu na ribosomal subunits,
  • Cell-substrate junctions na focal adhesions.

Waandishi wanatafsiri uwepo wa protini za cytosolic na ribosomal katika aqueous humor kama ishara inayowezekana ya stress ya seli, late apoptosis au kuvuja kwa protini kutokana na necrosis katika miundo kama ciliary body, trabecular meshwork, iris au corneal endothelium. Vyanzo hivi vya seli havikuthibitishwa kimajaribio.

Kazi za molekuli

Protein binding, binding ya misombo ya kikaboni na heterocyclic, nucleic acid binding, RNA na mRNA binding, na structural constituents za ribosomu zilijitokeza.

Michakato ya kibaolojia

Biosynthesis ya misombo ya kikaboni yenye nitrojeni, cellular amide na peptide metabolism, michakato mbalimbali ya catabolic, uundaji wa ribonucleoprotein complex na uelekezaji wa protini kwenye membrane viliongezeka.

Uchanganuzi wa KEGG: Nishati, usanisi wa protini na kifo cha seli

Kielelezo 4B kinaonyesha mojawapo ya enrichment kubwa katika njia ya ribosomu. Njia nyingine zinazoonekana ni:

  • Glycolysis na gluconeogenesis,
  • Fructose na mannose metabolism,
  • Pentose phosphate pathway,
  • Oxidative phosphorylation,
  • Vitamin B6 metabolism,
  • O-glycan biosynthesis,
  • RNA degradation na ribosome biogenesis,
  • Base excision repair,
  • Necroptosis,
  • Udhibiti wa actin cytoskeleton,
  • Antigen processing na presentation.

Muundo huu umetafsiriwa na watafiti kama mwonekano unaowezekana wa kuongezeka kwa hitaji la ATP na NADPH katika mazingira ya shinikizo kubwa ndani ya jicho, uwezekano wa ischemia-hypoxia, oxidative stress na viral/systemic inflammation.

Katika sehemu ya “Human Diseases” ya KEGG, pamoja na COVID-19, kuna pia vichwa kama influenza, HIV, hepatitis C, Epstein–Barr virus, Salmonella, neurodegenerative diseases, Parkinson disease, amyotrophic lateral sclerosis na pancreatic cancer. Enrichment hizi hazimaanishi kuwa wagonjwa walikuwa na magonjwa haya. Zinamaanisha kwamba protini zilezile zinahusika katika mitandao ya pamoja ya inflammation, stress, mitochondria na cell death inayotumika katika magonjwa tofauti.

Uchanganuzi wa Reactome: Kupangwa upya kwa kifaa cha tafsiri

Kielelezo 4C kinaonyesha karibu kila hatua ya usanisi wa protini:

  • Eukaryotic translation initiation,
  • Cap-dependent translation initiation,
  • Michakato ya 40S na 60S ribosomal subunits,
  • Peptide chain elongation,
  • Translation termination,
  • Viral mRNA translation,
  • rRNA processing na modification,
  • mRNA splicing,
  • Nonsense-mediated mRNA decay.

Interferon alpha/beta signaling, ISG15 antiviral mechanism, antiviral activity ya interferon-stimulated genes, na interleukin-12 na interleukin-21 signaling pia viliongezeka.

Phagocytosis, RHO na RAC GTPases, actin dynamics, axon guidance, DNA repair, telomere maintenance, SUMOylation na VEGF/VEGFR2 signaling pia ni michakato mingine iliyoangaziwa.

Uchanganuzi wa WikiPathways

Kielelezo 4D kinaonyesha enrichment ya juu zaidi katika cytoplasmic ribosomal proteins. Pia kuna mada zifuatazo:

  • Translation factors,
  • mRNA processing,
  • SARS-CoV-2 nsp1 protein kuzuia host translation initiation,
  • Moduli zinazoshirikiwa na mwitikio wa kinga katika acute viral myocarditis na tuberculosis,
  • Base excision repair,
  • Sphingolipid degradation,
  • NAD+ metabolism,
  • Cori cycle,
  • EGF/EGFR na MAPK/ERK signaling.

Waandishi wanahusisha enrichment ya ribosomu na translation factors na jitihada za seli kuongeza uwezo wa usanisi na urekebishaji wa protini dhidi ya athari ya SARS-CoV-2 ya kukandamiza usanisi wa protini za mwenyeji na dhidi ya acute pressure stress. Uwezekano mwingine ni kuvuja kwa vipengele vya ribosomu kutoka seli zilizoharibika kwenda kwenye aqueous humor. Utafiti hautofautishi maelezo haya mawili.

Exosomes na vesicles za nje ya seli

Kuongezeka kwa terms za extracellular vesicle na exosome katika GO analysis kumeibua wazo kwamba inflammatory mediators, molecules zinazohusiana na coagulation au fibrosis, na extracellular matrix regulators zinaweza kusafirishwa kupitia vesicles.

Waandishi wanapendekeza kuwa hili linaweza kuimarisha dysfunction ya trabecular meshwork, resistance ya aqueous humor outflow na mazingira ya uchochezi. Hata hivyo, vesicles hazikutengwa kivyake na vyanzo vya seli havikutambuliwa.

Actin cytoskeleton na trabecular meshwork

Enrichment zinazohusiana na actin cytoskeleton, RHO/RAC GTPases, cell-substrate junctions na focal adhesions zinaashiria uwezekano wa mabadiliko katika umbo la seli, adhesion na usambazaji wa membrane proteins.

Watafiti wanapendekeza kuwa mabadiliko haya yanaweza kuathiri muundo wa seli za trabecular meshwork na resistance ya utokaji wa majimaji. Hata hivyo, tishu ya trabecular meshwork haikuchunguzwa moja kwa moja, na cell mechanics au fluid flow haikupimwa kimajaribio.

Oxidative stress na urekebishaji wa DNA

Kuonekana kwa pamoja kwa pentose phosphate pathway, oxidative phosphorylation, NAD+ metabolism, base excision repair na cellular stress pathways kumetafsiriwa kama uwezekano wa oxidative damage chini ya shinikizo kubwa ndani ya jicho, ischemia-reperfusion na systemic inflammation.

Hata hivyo, reactive oxygen species, DNA damage, mitochondrial function au antioxidant capacity havikupimwa moja kwa moja. Pathway enrichment huibua nadharia kuhusu michakato hii; haiithibitishi peke yake.

Mwitikio wa kuzuia virusi ni wa kinga au wa madhara?

Kazi ya kwanza ya mhimili wa STAT1–ISG15–MX1–IFIT1/3 ni kupunguza kujizalisha kwa virusi. Kwa hiyo, kuongezeka kwa protini kunaweza kuonyesha kuwashwa kwa ulinzi wa mwenyeji.

Hata hivyo, mwitikio wa muda mrefu au uliopitiliza wa interferoni unaweza kuchangia mkusanyiko wa inflammatory mediators, kuingia kwa immune cells, vascular permeability na edema katika miundo ya utokaji wa majimaji. Waandishi wanapendekeza kuwa mhimili una uwezo wa kuwa na ulinzi wa kuzuia virusi na pia immunopathology.

Utafiti haukupima ukubwa wa athari za kinga na madhara. Hakuna correlation ya kliniki inayotolewa kuonyesha kwamba kuongezeka kwa protini kunapunguza au kuongeza ukali wa ugonjwa.

Je, COVID-19 ilithibitishwa kuwapo ndani ya jicho?

Hapana. Utafiti haukuchunguza SARS-CoV-2 PCR katika aqueous humor, antigen ya virusi, protini ya virusi, viral culture au uwepo wa virusi ndani ya tishu.

Kuongezeka kwa protini zinazochochewa na interferoni kunaweza kuonyesha kwamba maambukizi ya mfumo mzima wa mwili yanaakisiwa katika mazingira ya kinga ndani ya jicho. Hata hivyo, ugunduzi huu si ushahidi wa moja kwa moja wa virusi hai ndani ya jicho.

Je, inajulikana protini zilitoka kwenye seli gani?

Hapana. Protini katika aqueous humor zinaweza kutoka:

  • Ciliary body,
  • Iris,
  • Trabecular meshwork,
  • Corneal endothelium,
  • Immune cells zinazoingia ndani ya jicho,
  • Protini za mfumo mzima wa mwili zinazovuka blood-aqueous barrier iliyoharibika,
  • Seli zilizoharibika au kufa.

Kwa kuwa single-cell analysis, spatial proteomics, immunohistochemistry au uthibitishaji wa tishu haukufanywa, vyanzo vya seli havikuweza kutambuliwa.

Uwezekano wa biomarker

Waandishi wanaeleza kuwa STAT1, ISG15, MX1, IFIT1 na IFIT3 zinaweza kuwa wagombea wa biomarker katika matatizo ya macho yanayohusiana na COVID-19. Ili hilo liwezekane, angalau hatua zifuatazo zinahitajika:

  • Kuthibitisha muundo huo wa protini katika makundi makubwa na huru ya wagonjwa,
  • Kulinganisha makundi ya udhibiti ya watu wenye afya, AACC bila COVID-19, COVID-19 bila AACC na magonjwa mengine ya macho,
  • Uthibitishaji wa kiasi kwa targeted mass spectrometry, ELISA au njia huru zinazofanana,
  • Kuhesabu sensitivity, specificity, positive na negative predictive values,
  • Kuhusisha viwango vya protini na shinikizo ndani ya jicho, upotevu wa kuona na matokeo ya muda mrefu,
  • Kufafanua clinical thresholds na muda wa kuchukua sampuli.

Kwa kuwa hakuna diagnostic performance analysis iliyofanywa katika utafiti wa sasa, protini hizi haziwezi kuitwa clinical biomarkers kwa sasa.

Uwezekano wa kuwa lengo la matibabu

Makala inataja JAK–STAT inhibitors, ISGylation regulators na mbinu zinazobadilisha translation suppression kama mielekeo ya matibabu inayoweza kuchunguzwa siku zijazo.

Hakuna dawa iliyotolewa katika utafiti, hakuna dose-response experiment iliyofanywa, hakuna mabadiliko ya shinikizo ndani ya jicho yanayohusishwa na matibabu yaliyopimwa, na hakuna animal au cell model iliyotumika. Kwa kuwa kukandamiza mhimili wa ulinzi wa kuzuia virusi kunaweza pia kudhoofisha udhibiti wa maambukizi, mapendekezo haya ni nadharia za utafiti wa majaribio tu.

Nguvu za utafiti

  • Unachunguza aqueous humor ya binadamu iliyochukuliwa moja kwa moja kutoka chumba cha mbele cha jicho.
  • Kwa kulinganisha COVID-19–AACC na AACC bila COVID-19, unadhibiti kwa kiasi athari ya pamoja ya kufungwa kwa pembe kali.
  • Kuwapo kwa wagonjwa katika kipindi cha papo hapo cha kliniki katika makundi yote mawili kunafanya muktadha wa kliniki ufanane zaidi.
  • Sampuli zilichukuliwa na daktari mmoja wa upasuaji kwa njia iliyosanifishwa.
  • Uchunguzi mpana wa exploratory proteomics ulifikia protini 4.588.
  • Mabadiliko ya protini yalilinganishwa kwa hifadhidata nne tofauti za pathways.
  • Mhimili wa interferoni uliounganishwa kikazi ulipendekezwa badala ya protini moja moja.
  • Kushirikisha orodha pana za fold-change na P values katika majedwali ya ziada kunaruhusu mapitio huru.
  • Ethics approval, written consent, funding, conflict of interest na data availability statements zimetolewa.

Mapungufu makuu ya utafiti

  • Sampuli ndogo sana: Kuna wagonjwa wanane tu katika kila kundi.
  • Kituo kimoja: Wagonjwa wote walitoka hospitali moja katika eneo hilo.
  • Hakuna power analysis: Haijaelezwa sampuli ya watu wanane inaweza kugundua tofauti ya ukubwa gani kwa kutegemewa.
  • Maelfu ya ulinganisho: Utekelezaji wa multiple-testing correction na uainishaji wa majedwali hauko wazi.
  • Majedwali ya takwimu hayawiani: Protini nyingi zilizokubaliwa kuwa tofauti zina P>0,05.
  • Jumla ya protini haijaelezwa: Haijaandikwa wazi kwa nini ni 3.946 tu kati ya protini 4.588 zilizotambuliwa ziliingia katika makundi matatu ya matokeo.
  • Mgongano wa 203–132: Idadi ya protini tofauti katika sehemu za matokeo na mjadala haipatani.
  • Makundi ya udhibiti ni machache: Hakuna watu wenye afya, wagonjwa wa COVID-19 bila AACC au udhibiti wa magonjwa mengine ya uchochezi wa macho.
  • Hauonyeshi causality: Haijathibitishwa kwamba maambukizi ya COVID-19 yalisababisha kufungwa kwa pembe.
  • Uwepo wa virusi haukupimwa: SARS-CoV-2 RNA au antigen katika aqueous humor haikuchunguzwa.
  • Chanzo cha seli hakijulikani: Haijaamuliwa kama protini zinatoka kwenye tishu za jicho, mzunguko wa damu au immune cells.
  • Hakuna uthibitishaji huru wa protini: Targeted proteomics, Western blot, ELISA au immunohistochemical validation haikuripotiwa.
  • Hakuna functional validation: Athari ya kukandamiza STAT1 au protini nyingine kwenye shinikizo ndani ya jicho na inflammation haikupimwa.
  • Maelezo ya mbinu hayatoshi: Kifaa, programu, mass spectrometry settings na data-processing algorithms hazijakamilika.
  • Maelezo ya COVID-19 hayatoshi: Muda wa maambukizi, ukali, hali ya chanjo na matibabu hayakuripotiwa kwa kiwango cha mgonjwa.
  • Confounders hazikudhibitiwa: Hakuna multivariable analysis kwa umri, jinsia, shinikizo la damu, kisukari na matibabu.
  • Hakuna P values katika baseline comparisons: Kauli ya “hakuna tofauti” haiwezi kukaguliwa kupitia jedwali.
  • Blinding haijaelezwa: Haijulikani kama wakaguzi wa maabara na kliniki walikuwa hawajui taarifa za makundi.
  • Maelezo ya pathway analysis hayatoshi: Background protein universe, minimum gene/protein count na multiple-testing correction havikutolewa.
  • Matokeo ya DO hayajaonyeshwa: Ingawa Disease Ontology analysis imetajwa katika mbinu, hakuna matokeo tofauti yaliyoonyeshwa.
  • Kigezo cha PPI hub hakijaelezwa: Centrality algorithm au threshold haijaripotiwa.
  • Hakuna long-term follow-up: Uhusiano wa wasifu wa protini na kuona, mashambulio yanayojirudia au kuendelea kwa glaucoma haukuchunguzwa.
  • Hakuna peer review: Hati bado haijapitia tathmini huru ya rika.

Utafiti unasema nini?

  • Muundo tofauti wa protini ulionekana katika aqueous humor ya wagonjwa wa AACC wenye maambukizi ya COVID-19.
  • Protini STAT1, ISG15, MX1, IFIT1 na IFIT3 zilipimwa juu zaidi katika kundi la COVID-19–AACC.
  • Protini hizi tano zimeunganishwa kikazi katika mitandao inayojulikana ya interferoni na mwitikio wa kuzuia virusi.
  • Mabadiliko ya protini hayahusiani tu na pathways za kuzuia virusi, bali pia na ribosomu, uchakataji wa RNA, kimetaboliki ya nishati, oxidative stress, cytoskeleton na vascular signaling.
  • Aqueous humor inaweza kuwa sampuli ya kibaolojia inayoakisi mabadiliko ya kinga ndani ya jicho yanayohusiana na maambukizi ya virusi ya mfumo mzima wa mwili.
  • Protini msingi zinaweza kuchunguzwa katika tafiti kubwa zaidi kama wagombea wa biomarker na mechanistic targets.

Utafiti hausisemi nini?

  • Hauonyeshi kwamba COVID-19 husababisha kwa hakika kufungwa kwa pembe kali.
  • Hauhesabu hatari ya AACC huongezeka mara ngapi kwa watu waliopata COVID-19.
  • Hauonyeshi kwamba kuna virusi hai au viral RNA katika aqueous humor.
  • Haithibitishi kwamba mhimili wa STAT1–ISG15–MX1–IFIT1/3 ndio sababu ya kufungwa kwa pembe.
  • Hautambui ni seli zipi za jicho huzalisha protini hizi.
  • Hauonyeshi kwamba protini hizi zina sensitivity na specificity ya kutosha kwa utambuzi.
  • Hauonyeshi kwamba dawa zinazolenga JAK–STAT au ISG15 zinafaa au ni salama kwa wagonjwa.
  • Hausemi kwamba magonjwa mengine yanayoonekana katika pathway enrichment yalikuwepo kwa washiriki.
  • Haithibitishi kwamba matokeo ya kuona ya wagonjwa wa COVID-19–AACC ni mabaya zaidi kuliko ya kundi la udhibiti.
  • Hauonyeshi kwamba matokeo yanatumika moja kwa moja kwa nchi tofauti, viral variants au makundi tofauti ya wagonjwa.

Umuhimu kwa mtazamo wa zamani, sasa na siku zijazo

Kwa mtazamo wa zamani

Tafiti za proteomics kuhusu athari za mfumo mzima wa COVID-19 nje ya jicho hapo awali zililenga zaidi damu na immune cells. Utafiti huu unapendekeza kwamba mitandao hiyo hiyo ya kuzuia virusi inaweza kufuatiliwa pia katika ugonjwa wa macho wa papo hapo moja kwa moja ndani ya sampuli za aqueous humor.

Kwa mtazamo wa sasa

Utafiti unachunguza uhusiano unaowezekana kati ya maambukizi ya mfumo mzima wa mwili na shambulio la shinikizo ndani ya jicho si kupitia mpangilio wa muda wa kliniki pekee, bali kupitia mazingira ya protini ndani ya jicho. Mchango wake mkuu si kupendekeza matibabu ya uhakika, bali kutambua mhimili wa molekuli unaoweza kuchunguzwa.

Kwa mtazamo wa siku zijazo

Ikiwa sampuli kubwa zaidi, miundo ya vituo vingi, makundi ya udhibiti yenye afya na magonjwa, targeted protein validation, viral analyses, single-cell na spatial methods, na experimental models zitatumika, maswali yafuatayo yanaweza kujibiwa:

  • Je, mhimili wa interferoni huwashwa kabla au baada ya AACC?
  • Je, protini hutoka kwenye tishu za jicho au katika mzunguko wa mfumo mzima?
  • Je, viwango vya protini vinahusiana na shinikizo ndani ya jicho au upotevu wa kuona?
  • Je, mhimili huu ni mahususi kwa COVID-19 au pia kwa maambukizi mengine ya virusi?
  • Je, protini fulani zinaweza kutabiri ukali wa ugonjwa au matokeo ya muda mrefu?
  • Je, uchochezi wenye madhara unaweza kupunguzwa kwa kuchagua bila kuharibu ulinzi wa kuzuia virusi?

Mbinu na Matokeo ya Utafiti

Kipengele cha kiufundiUtekelezaji katika utafiti
Aina ya utafitiUtafiti wa proteomics wa kituo kimoja, uchunguzi, exploratory case-control
Kipindi cha utafitiJanuari 2023–Oktoba 2023
KituoIdara ya Ophthalmology, Liaocheng People’s Hospital
Jumla ya sampuliWagonjwa 16 na macho 16
Kundi la majaribioWagonjwa 8 wenye AACC pamoja na maambukizi ya COVID-19
Kundi la udhibitiWagonjwa 8 waliotambuliwa AACC bila COVID-19
Vigezo vya kutengwaUgonjwa mwingine wa jicho au historia ya upasuaji wa jicho uliopita
Sampuli iliyochukuliwaTakribani 100 µL aqueous humor
Uhifadhi wa sampuliKwa muda juu ya barafu, kisha –80 °C
Njia ya kuchukua sampuliAnterior chamber paracentesis kupitia clear corneal limbus
Enzyme ya proteolysisTripsini
Jukwaa la uchanganuziHPLC-DIA mass spectrometry iliyofafanuliwa kama 4D-DIA
Peptide/protein FDR<%1 katika ngazi zote mbili
PreprocessingLogarithmic transformation, missing-value imputation na normalization
Kizingiti katika sehemu ya matokeoFold-change >1,5 na P<0,05 katika two-tailed Student t-test
Kizingiti cha ziada katika mbinuq<0,05 baada ya multiple-testing correction; maelezo ya utekelezaji hayajatolewa
Protini zilizotambuliwa4.588
Protini zilizopimwa katika angalau %50 ya sampuli3.946
Protini zilizopimwa katika sampuli zote2.450
Protini zilizoongezeka zilizoripotiwa82
Protini zilizopungua zilizoripotiwa121
Protini zisizobadilika zilizoripotiwa3.743
Hifadhidata za kiutendajiGO, KEGG, Reactome, WikiPathways na Disease Ontology katika sehemu ya mbinu
Mtandao wa mwingiliano wa protiniSTRING
Mhimili msingi ulioangaziwaSTAT1–ISG15–MX1–IFIT1–IFIT3
Uthibitishaji huruHaujaripotiwa
Ufuatiliaji wa muda mrefuHaupo

Muhtasari wa kiufundi wa mhimili msingi

HatuaProtiniMabadiliko yaliyoripotiwaTafsiri ya kibaolojia ya utafiti
Uhamishaji wa isharaSTAT1Ongezeko mara 1,752Hubadilisha ishara za interferoni na cytokine kuwa usemi wa jeni za ISG ndani ya kiini
Udhibiti baada ya tafsiriISG15Ongezeko mara 3,247Hudhibiti kazi ya protini za kuzuia virusi na muda wa mwitikio kupitia ISGylation
Efekta ya kuzuia virusiMX1Ongezeko mara 2,598Shughuli ya GTPase inayoweza kuvuruga nucleocapsid na replication complexes za virusi
Ukandamizaji wa RNA ya virusiIFIT1Ongezeko mara 3,352Huzuia tafsiri ya RNA ya virusi isiyo na muundo sahihi wa cap
Kuimarisha isharaIFIT3Ongezeko mara 1,879Huimarisha complex ya IFIT1 na kuongeza ishara ya kuzuia virusi

Hitimisho la pamoja la uchanganuzi wa pathways

Mada ya kibaolojiaMatokeo yaliyoangaziwaMaana ya ushahidi
Kinga ya kuzuia virusiRIG-I-like receptors, interferon alpha/beta, ISG15 na IFN-stimulated genesMtandao wa protini unaohusiana na interferoni umeamilishwa katika kundi la COVID-19–AACC
Usanisi wa protiniRibosomu, translation initiation, elongation, termination na mRNA processingUwezekano wa kupangwa upya kwa kifaa cha usanisi wa protini kinachohusiana na stress au repair
Nishati na redoxGlycolysis, pentose phosphate pathway, oxidative phosphorylation na NAD+ metabolismNadharia ya kuongezeka kwa mahitaji ya nishati na reducing power
Uharibifu wa seliNecroptosis, DNA base-excision repair na stress responsesDalili zisizo za moja kwa moja kuhusu ischemia, oxidative stress au inflammatory cell death
Muundo wa seliActin cytoskeleton, RHO/RAC GTPases na focal adhesionNadharia ya mabadiliko ya kimuundo yanayowezekana katika trabecular meshwork na outflow structures
Vesicle na secretionExosomes na extracellular vesiclesUwezekano wa usafirishaji wa molecules za uchochezi au matrix regulators
Mishipa na remodelingVEGF/VEGFR2, EGFR na MAPK/ERKNadharia ya utafiti kwa vascular permeability, inflammation na tissue remodeling

Onyo kuhusu kiwango cha ushahidi: Matokeo ya pathway yanaonyesha mwingiliano wa kitakwimu kati ya orodha ya protini na mahusiano yanayojulikana katika hifadhidata. Cell death, viral translation, oxidative DNA damage, trabecular meshwork contraction au vascular permeability havikupimwa moja kwa moja katika utafiti huu.

Onyo la takwimu: PDF ina kutokuwiana kusikotatuliwa kati ya idadi ya protini tofauti, vizingiti vya P/q na uainishaji wa majedwali. Kwa hiyo, hasa orodha za protini nje ya mhimili msingi hazipaswi kutumiwa kama matokeo yaliyothibitishwa kwa uhakika.

Maelezo ya Chanzo na Mbinu

  • Kichwa kamili asilia:COVID-19-Associated AACC: Proteomic Signatures and Activation of the STAT1–ISG15–MX1–IFIT1/3 Axis
  • Waandishi kwa mpangilio wao: Juan Zheng; Zhenzhen Wang; Yuanfei Wang; Limin Yang; Ruimei Yin; Dongdong Zhao; Longchao Gu; Rongrong Li; Cuncun Yang; Xinying You
  • Mchango sawa au uandishi mwenza wa kwanza: Haukurekodiwa
  • Mwandishi anayewasiliana katika PDF: Xinying You
  • Mwandishi wa mawasiliano katika SSRN: Juan Zheng
  • Kutokuwiana kwa mwandishi wa mawasiliano: PDF na metadata ya SSRN hazionyeshi mtu yuleyule

Taasisi za waandishi

  1. Joint Laboratory for Translational Medicine Research, Liaocheng People’s Hospital, Liaocheng, Shandong, China
  2. Liaocheng Key Laboratory of Ophthalmology, Liaocheng People’s Hospital, Liaocheng, Shandong, China
  3. Department of Ophthalmology, Liaocheng Eye Hospital, Liaocheng, Shandong, China
  4. Qingdao Medical College, Qingdao University, Qingdao, Shandong, China
  5. Department of Ophthalmology, Liaocheng People’s Hospital, Liaocheng, Shandong, China
  • Aina ya chanzo: Preprint ya utafiti wa kitabibu
  • Jukwaa la uchapishaji: SSRN
  • Nambari ya rekodi ya SSRN: 6961656
  • DOI: 10.2139/ssrn.6961656
  • Tarehe ya kupakiwa SSRN: 18 Juni 2026
  • Idadi ya kurasa: 114
  • Hali ya peer review: Haijapitia tathmini ya rika
  • Jarida: Hakuna taarifa ya jarida lililopitiwa na rika
  • Mkutano: Hakuna taarifa ya mkutano
  • Mchapishaji asilia wa kitaaluma: Hakuweza kuthibitishwa
  • Kiungo rasmi cha SSRN:https://ssrn.com/abstract=6961656
  • Kiungo cha DOI:https://doi.org/10.2139/ssrn.6961656

Idhini ya maadili

Utafiti unasema kwamba wagonjwa wote walitoa informed written consent na kwamba kanuni za Declaration of Helsinki zilifuatwa. Nambari ya idhini ya maadili ni 2022327.

Jina la taasisi ya kamati ya maadili haliko thabiti katika hati. Sehemu ya mbinu inataja institutional review board ya hospitali, tamko la mwisho la maadili linataja Medical Ethics Committee ya Dongchangfu People’s Hospital, huku metadata ya SSRN ikionyesha Institutional Review Board ya Liaocheng People’s Hospital.

Michango ya waandishi

  • Juan Zheng na Xinying You: Conceptualization na design ya utafiti
  • Zhenzhen Wang, Ruimei Yin na Dongdong Zhao: Utekelezaji wa utafiti
  • Longchao Gu, Rongrong Li, Cuncun Yang, Yuanfei Wang na Limin Yang: Data analysis na interpretation
  • Waandishi wote: Kuandika, kupitia na kuidhinisha maandishi ya mwisho
  • Juan Zheng na Xinying You: Wajibu wa kuthibitisha uhalisi wa raw data

Ufadhili

  • Affiliated Hospital (Teaching Hospital) Research and Development Foundation of Shandong Second Medical University: 2024FYM133, 2025FYM133 na 2025FYM139
  • Policy-Guided Scientific and Technological Projects of Key R&D Plan in Liaocheng City: 2024YD41 na 2025YD34
  • Shandong Province Medical and Health Technology Development Plan Project: 202507021046 na 202107020506

Jukumu la wafadhili katika design ya utafiti, data analysis au uamuzi wa kuchapisha halijaelezwa kando.

Ushirikishaji wa data na mgongano wa maslahi

Imeelezwa kwamba data sets zinaweza kuombwa kwa mwandishi anayewasiliana kwa ombi linalofaa. Hakuna kiungo cha open data repository, raw mass-spectrometry files, analysis code au detailed processing protocol kilichotolewa.

Waandishi wametangaza kutokuwa na mgongano wa maslahi.

Maelezo ya matumizi ya chanzo

Maudhui ya kisayansi ya makala hii ya Verianla yametayarishwa kwa msingi wa PDF yote iliyopakiwa. Hakuna ugunduzi mpya wa kliniki, utaratibu wa molekuli, data ya mgonjwa au matokeo ya matibabu yaliyoongezwa kutoka nje ya PDF. Uthibitishaji wa nje ulitumika tu kukagua kichwa, waandishi, nambari ya rekodi ya SSRN, DOI, tarehe ya kupakiwa, metadata ya taasisi na hali ya peer review.

Mapungufu makuu ya utafiti ni sampuli ndogo ya kituo kimoja, kutokuwa wazi kwa uripoti wa multiple comparisons, kukosekana kwa uthibitishaji huru wa protini, kutopimwa kwa uwepo wa virusi, kutokujulikana kwa chanzo cha seli, udogo wa makundi ya udhibiti na kutokamilika kwa peer review.

Maelezo ya wigo wa kitabibu: Utafiti huu ni exploratory biomedical research. Hauundi ushauri wa kitabibu wa mtu binafsi kuhusu uchunguzi wa macho, ufuatiliaji wa glaucoma au matibabu kwa mtu aliyewahi kupata COVID-19. Maumivu ya jicho ya ghafla, kupungua kwa kuona, maumivu ya kichwa, kichefuchefu au kuona duara za mwanga kuzunguka taa ni dalili zinazoweza kuhitaji tathmini ya dharura ya macho.


Shiriki:

Maoni huchapishwa baada ya kukaguliwa.Maoni yako yatapitia mchakato wa idhini na yataonekana yakikubaliwa.

Acha maoni

Anwani yako ya barua pepe haitachapishwa. Sehemu za lazima zimewekewa alama ya *

Your experience on this site will be improved by allowing cookies Cookie Policy