Biosensa ya fluoresensi inayotegemea aptamer ni jukwaa la biosensa linalotumia aptamer ya asidi ya nukleiki yenye mnyororo mmoja kuitambua kwa uteuzi molekuli lengwa na kubadilisha tukio hilo la utambuzi wa kimolekuli kuwa mabadiliko ya fluoresensi yanayoweza kupimwa. Mapitio haya yanalinganisha aptasensa za fluoresensi kwa ajili ya kubaini antibiotiki ya aminoglycoside kanamycin (kanamycin, KANA) katika maziwa, nyama, asali na mifumo mingine tata ya chakula kwa kuzingatia uteuzi wa aptamer, uthibitishaji wa kufungamana, uzalishaji wa ishara zenye lebo na zisizo na lebo, nanomateriali, ukuzaji wa asidi ya nukleiki, aptamer zilizogawanywa, mwingiliano wa matriksi ya chakula na mpito kuelekea matumizi ya uwanjani.
Moja ya ujumbe muhimu zaidi wa kisayansi wa mapitio haya ni kwamba sensa kuonyesha kikomo cha ugunduzi (Limit of Detection, LOD) cha chini sana hakuthibitishi kuwa aptamer iliyotumika hufungamana na lengo kwa kiwango sawa cha juu cha affinity ya ndani. Nguvu ya thermodynamics ya kufungamana kati ya aptamer na lengo kwa kawaida hutathminiwa kwa kutumia konstant ya dissociation Kd, ilhali LOD huathiriwa si tu na utambuzi wa lengo bali pia na ufanisi wa ubadilishaji wa fluoresensi, ukuzaji wa ishara, ukandamizaji wa usuli, usindikaji wa awali wa sampuli na uwezo wa kifaa kusoma. Kwa hiyo Kd na LOD si kiasi kilekile na haviwezi kutumiwa moja kwa moja badala ya kila kimoja.
Tofauti hii ni muhimu hasa kwa KANA-1. Kwa KANA-1, aptamer ya kwanza ya KANA, utafiti wa awali uliotegemea lengo lililowekwa kwenye uso uliripoti Kd inayoonekana ya 78,8 nM. Kinyume chake, tafiti za baadaye za kalorimetri ya titration isothermal (Isothermal Titration Calorimetry, ITC) zilizofanywa katika suluhisho hazikuweza kuthibitisha kufungamana kulekule kwa nguvu na kwa umaalumu na KANA huru. Licha ya hayo, mapitio yanajadili kwa tahadhari ukweli kwamba sensa nyingi za fluoresensi zinazotegemea KANA-1 zimeripoti LOD katika viwango vya nano- na pikomola. Maelezo yanayowezekana ni pamoja na kwamba katika michakato ya awali ya uteuzi huenda kulichaguliwa kufungamana kusiko maalumu na uso mgumu au vikundi vya kuunganisha, na kwamba ukuzaji mkubwa wa ishara unaweza pia kuongeza mwingiliano usio maalumu.
Aptamer mpya zaidi zinajaribu kushughulikia tatizo hili kwa kiasi. Kwa KANA-4 imeripotiwa 320 nM kwa ITC, na kwa KANA-5 imeripotiwa 51 ± 5 nM Kd kwa ITC katika pH 7,5. Mapitio yanaangazia KANA-5 kama moja ya aptamer za KANA zenye affinity ya juu zaidi katika fasihi iliyojumuishwa ambazo zina uthibitisho thabiti wa kufungamana katika suluhisho karibu na hali za kifiziolojia. Hata hivyo, uteuzi bado ni muhimu; imeripotiwa kuwa KANA-4 na KANA-5 zinaweza kuonyesha kufungamana kwa kuvukiana kwa kiwango fulani na aminoglycoside zinazohusiana kimuundo, kama tobramycin.
Aptasensa za fluoresensi huchunguzwa katika familia mbili pana za usanifu. Katika mifumo yenye lebo, fluorophore kama FAM, Cy3 au Cy5 pamoja na vizimaji kama BHQ1, nanoparticles za dhahabu, graphene au carbon nanotubes zinaweza kutumika. Katika mifumo isiyo na lebo, rangi zinazohisi muundo kama Thioflavin T (ThT), thiazole orange (TO), N-methyl mesoporphyrin IX (NMM), SYBR Green I au sifa asilia za fluoresensi za nanocluster za kaboni na metali zinaweza kutumika.
Ukuzaji wa ishara wa asidi ya nukleiki unaweza kupunguza LOD zaidi. Mapitio yanajadili mbinu kama catalytic hairpin assembly (Catalytic Hairpin Assembly, CHA), hybridization chain reaction (Hybridization Chain Reaction, HCR), rolling circle amplification (RCA), strand displacement amplification (SDA), mifumo ya DNA walker na urejelezaji wa lengo unaosaidiwa na exonuclease. Mbinu hizi zinaweza kuzalisha ishara nyingi za fluoresensi kutokana na tukio moja au machache ya utambuzi wa lengo; hata hivyo, zinaweza kuleta vipengele vya ziada, muda mrefu zaidi wa mchakato, hitaji la uboreshaji na hatari ya kukuza ishara ya usuli isiyo maalumu.
Moja ya vikwazo vikubwa katika uchanganuzi wa chakula halisi ni athari ya matriksi. Protini na mafuta ya maziwa, biomolekuli za nyama, kiwango kikubwa cha sukari katika asali na ioni kwenye vyakula zinaweza kubadilisha adsorption ya aptamer kwenye uso, uundaji wa G-quadruplex, tabia ya nanoparticles na nguvu ya fluoresensi bila kutegemea KANA lengwa. Kwa hiyo LOD ya chini ya sensa katika suluhisho safi la buffer haimaanishi kwamba usahihi uleule wa kiasi utapatikana katika chakula halisi kisichosindikwa.
Hitimisho la jumla la mapitio ni kwamba aptasensa za fluoresensi zinaunda jukwaa lenye nguvu la utafiti kwa uchunguzi wa KANA wa haraka, unaohitaji vifaa vichache na unaoweza kufanywa kwa vifaa vinavyobebeka. Hata hivyo, haiwezi kusemwa kwamba zimechukua nafasi ya mbinu za marejeo kama LC-MS/MS kwa upande wa kalibresheni iliyosanifishwa, uthibitishaji katika matriksi halisi ya chakula, urudiwaji kati ya batches, uthabiti wa muda mrefu na ukubalifu wa udhibiti. Utafiti unatathmini teknolojia hizi si kama suluhisho tayari na la kibiashara la kila mahali, bali kama majukwaa ya sensa yanayoendelea kukua ambayo mpito wake kutoka mafanikio ya maabara hadi matumizi ya uwanjani yenye kuaminika bado unahitaji uthibitishaji.
Kwa nini kanamycin hufuatiliwa kwa usalama wa chakula?
Kanamycin (KANA) ni antibiotiki ya kundi la aminoglycoside. Chanzo kinaeleza kuwa matumizi kupita kiasi au yasiyofaa katika mifugo na tiba ya wanyama yanaweza kusababisha mabaki katika vyakula vya asili ya wanyama na kwamba kwa sababu hiyo ufuatiliaji wa mabaki ni muhimu kwa usalama wa chakula.
Katika utangulizi, mapitio yanatoa kama mifano ya mipaka ya udhibiti viwango vya juu vya mabaki vya 150 µg/kg kwa maziwa katika Umoja wa Ulaya na 200 µg/kg nchini China. Viwango hivi ni mifano ya udhibiti iliyotolewa na mapitio kwa kutaja vyanzo; havikutengenezwa na Verianla kama tathmini mpya au huru ya sheria.
Aptamer ni nini na inaweza kuitambuaje kanamycin?
Aptamer ni oligonucleotide ya DNA au RNA yenye mnyororo mmoja iliyochaguliwa ili kufungamana na molekuli mahususi lengwa na kwa kawaida huwa na takriban nukleotidi 15–100; katika aptasensa za KANA, aptamer hutambua antibiotiki lengwa kama kipengele cha utambuzi wa kimolekuli na mabadiliko ya muundo au ya uso yanayotokea kutokana na kufungamana hubadilishwa baadaye kuwa ishara ya fluoresensi.
Sababu kuu za kuchunguza aptamer kama mbadala wa molekuli za kawaida za utambuzi wa kibayolojia kama kingamwili na enzymes ni uwezo wa kutengenezwa kwa usanisi wa kikemia, utungaji unaoweza kudhibitiwa zaidi kati ya batches za uzalishaji, urahisi wa kufanyiwa marekebisho ya kikemia na uwezo wa kuunganishwa kwa urahisi katika usanifu mbalimbali wa sensa.
SELEX ni nini?
Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment (SELEX) ni mbinu ya kuchagua aptamer ambapo mfuatano unaoonyesha sifa bora zaidi za kufungamana na lengo maalumu hutajirishwa kupitia duru zinazofuatana za uteuzi na uongezaji kutoka kwenye mkusanyiko mkubwa wa mifuatano nasibu ya asidi ya nukleiki.
Kwa molekuli ndogo, SELEX ya kawaida ina tatizo maalumu: kufunga lengo kwenye uso mgumu kunaweza kubadilisha upatikanaji au namna ya kuwasilishwa kikemia kwa molekuli lengwa. Zaidi ya hayo, asidi ya nukleiki inaweza kushikamana na bead, uso au kikundi cha kikemia cha kuunganisha badala ya lengo. Uwezekano huu uko katika msingi wa mjadala kuhusu KANA-1.
Kwa nini Capture-SELEX ilitengenezwa?
Katika Capture-SELEX, badala ya kufunga molekuli ndogo lengwa kwenye uso, maktaba ya oligonucleotide inaweza kuwekwa kwenye uso kupitia mfuatano wa kukamata unaokamilishana. Lengo huru linapowasili, mifuatano ya wagombea inayolifungamanisha inaweza kubadilika kimuundo, kujitenga na uso na kuchaguliwa. Mbinu hii inalenga kupunguza upotoshaji unaotokana na immobilization ya kikemia ya lengo dogo la kikaboni.
Maendeleo ya aptamer za KANA
| Aptamer | Mbinu ya uteuzi | Kd iliyoripotiwa | Mbinu ya uthibitishaji | Kikomo cha tafsiri |
|---|---|---|---|---|
| KANA-1 | Affinity Chromatography SELEX | 78,8 nM | Kufungamana kwa aptamer yenye lebo ya FAM kwenye beads zilizofunikwa KANA | Tafiti za baadaye za ITC katika suluhisho hazikuthibitisha kufungamana kulekule kwa nguvu na kwa umaalumu. |
| KANA-2.1 | Capture-SELEX | 3900 nM = 3,9 µM | Ligand-induced release | Usanifu tofauti wa uteuzi na KANA-1 ulitumika. |
| KANA-2.2 | Capture-SELEX | 5100 nM = 5,1 µM | Ligand-induced release | Baadaye ukawa msingi wa tafiti za uboreshaji unaotegemea muundo. |
| KANA-3 | NOS-immobilized SELEX | 92,3 nM | ELONA | Mbinu ya uthibitishaji inayotegemea uso mgumu ilitumika. |
| KANA-4 | Capture-SELEX | 320 nM | ITC | Affinity yake inategemea sana pH. |
| KANA-5 | Capture-SELEX | 51 ± 5 nM | ITC | Katika pH 7,5 ni mojawapo ya affinity za KANA zilizothibitishwa kwa nguvu zaidi zilizoripotiwa na mapitio. |
Kwa KANA-2.2, lahaja ya KANA-2b_opt yenye nukleotidi 42 ilitengenezwa kwa ufupishaji wa post-SELEX na uboreshaji unaotegemea muundo, na takriban 109 ± 15 nM Kd iliripotiwa. Mfano huu unaonyesha kwamba kuondoa mifuatano isiyo ya lazima baada ya uteuzi wa aptamer au kupanga upya usanifu wa muundo kunaweza kubadilisha utendaji wa kufungamana.
Tofauti kati ya Kd na LOD ni nini?
Kd huonyesha nguvu ya thermodynamics ya kufungamana kwa usawa kati ya aptamer na lengo, ilhali LOD huonyesha kiwango cha chini kabisa cha analiti ambacho mfumo mzima wa sensa unaweza kukitenganisha kwa kuaminika na usuli; kutokana na ukuzaji wa ishara, LOD inaweza kuwa chini sana kwa thamani ya nambari kuliko Kd ya aptamer, na hali hii pekee haionyeshi kwamba aptamer ina affinity ya juu kupita kiasi.
Hisabati ya kimawazo ya Kd
Mapitio ya chanzo hayatoi mlinganyo wazi wa Kd. Kwa usawa rahisi wa kufungamana wa 1:1, uhusiano wa kawaida ufuatao unaweza kutumiwa tu kama maelezo ya kielimu:
\[ A + K \rightleftharpoons AK \]
\[ K_d=\frac{[A][K]}{[AK]} \]
Hapa \(A\) inaonyesha aptamer huru, \(K\) KANA huru, na \(AK\) tata ya aptamer–KANA. Ikiwa viwango vya mkusanyiko vimetolewa katika kitengo kimoja, kitengo cha Kd ni mkusanyiko; katika mapitio haya nM au µM zimetumika mara nyingi.
Katika hali rahisi na zinazoweza kulinganishwa, Kd ya chini huashiria kufungamana kwa nguvu zaidi. Hata hivyo, si salama kupanga moja kwa moja thamani za Kd zilizopatikana kwa pH, buffer, nguvu ya ioni, namna ya immobilization na mbinu za kipimo tofauti.
Kwa nini LOD inaweza kuwa chini kuliko Kd?
Sensa si lazima isome kwa njia tulivu tu swali la “molekuli ngapi zimefungamana?”. Tukio moja la utambuzi wa lengo–aptamer linaweza kuanzisha mzunguko wa enzyme, DNA walker, HCR, CHA au mnyororo mwingine wa ukuzaji. Hivyo, matukio machache ya utambuzi yanaweza kutengeneza bidhaa nyingi za fluoresensi au mabadiliko mengi ya ishara.
Kwa hiyo LOD ya mfumo wa uchanganuzi ni matokeo ya mchanganyiko wa affinity ya kufungamana + ubadilishaji wa ishara + ukuzaji + kelele ya usuli + usomaji wa macho + uandaaji wa sampuli.
Mapitio hayaonyeshi kwamba tafiti tofauti zilitumia mlinganyo mmoja wa pamoja katika kukokotoa LOD. Kwa hiyo si sahihi kuhusisha \(3\sigma/S\) au mlinganyo mwingine wa LOD na tafiti zote za Jedwali 2 kana kwamba ni wa pamoja.
Kwa nini KANA-1 ni yenye mjadala wa kisayansi?
Thamani ya kwanza ya kufungamana ya 78,8 nM iliyoripotiwa kwa KANA-1 ilitokana na kufungamana kwa aptamer yenye lebo kwenye uso mgumu uliobadilishwa kwa KANA. Tafiti mbili huru za ITC zilizotajwa na mapitio hazikuweza kuthibitisha kufungamana kulekule kwa umaalumu kunakoweza kupimwa na KANA huru katika suluhisho.
Mapitio yanajadili maelezo mawili yanayowezekana ambayo hayapingani. Kwanza, katika hatua za awali za uteuzi baadhi ya mifuatano huenda ilionyesha upendeleo kwa uso mgumu au kemia ya kiunganishi badala ya KANA huru. Pili, usanifu wa sensa unaotumia nanomateriali au ukuzaji wa asidi ya nukleiki unaweza kukuza hata mabadiliko madogo ya ishara yasiyo maalumu na kutoa majibu ya uchanganuzi yanayoonekana kuwa makubwa.
Kwa hiyo data zilizochapishwa za utendaji wa sensa zinazotegemea KANA-1 hazipaswi kupuuzwa; hata hivyo, utambuzi maalumu wa kimolekuli unaosababisha utendaji huo unahitaji kuthibitishwa kando.
Tofauti kati ya aptasensa za fluoresensi zenye lebo na zisizo na lebo ni nini?
Katika aptasensa zenye lebo, fluorophore kama FAM, Cy3 au Cy5 au vizimaji maalumu huongezwa kwenye aptamer au mfuatano msaidizi wa DNA, ilhali mifumo isiyo na lebo husoma mabadiliko ya muundo yanayotegemea lengo kupitia rangi zinazohisi muundo kama ThT, TO, NMM, SYBR Green I au tabia asilia ya macho ya nanocluster za kaboni/metali; kuondoa lebo kunaweza kurahisisha usanisi na usafishaji, lakini hakufuti utegemezi wa ishara kwa matriksi na hali za ioni.
FRET hufanyaje kazi?
Uhamisho wa nishati kwa resonance ya Förster (FRET) ni uhamisho wa nishati unaotegemea sana umbali kati ya donor fluorophore iliyochochewa na acceptor yenye sifa zinazofaa za spektra. Fluorophore na kizimaji zinapokaribiana au kutengana, fluoresensi inaweza kubadilika.
Chanzo hakitoi mlinganyo wazi wa FRET. Uhusiano wa kawaida wa kifizikia ni huu kwa madhumuni ya maelezo ya kielimu pekee:
\[ E=\frac{1}{1+\left(\frac{r}{R_0}\right)^6} \]
Hapa \(E\) ni ufanisi wa FRET, \(r\) ni umbali kati ya donor–acceptor, na \(R_0\) ni umbali bainifu wa Förster ambapo ufanisi wa uhamisho wa nishati ni %50. Kutokana na utegemezi wa nguvu ya sita, mabadiliko madogo ya umbali yanaweza kuwa mabadiliko makubwa ya fluoresensi. Katika aptasensa, kubadilika kwa konformation ya DNA kutokana na kufungamana kwa lengo kunaweza kusababisha mabadiliko haya ya umbali.
SET na IFE si utaratibu mmoja
Surface Energy Transfer (SET) ni utaratibu wa kuzima unaotegemea uhamisho wa nishati kati ya fluorophore na hasa uso wa metali au kaboni. Carbon nanotubes na baadhi ya nyuso za nanoparticles zinaweza kutumiwa kwa kusudi hili.
Inner Filter Effect (IFE), kwa upande mwingine, inaweza kupunguza fluoresensi inayopimwa kwa sehemu moja kufyonza mwanga wa msisimko au utoaji bila kuhitaji uhamisho halisi wa nishati kati ya fluorophore na kizimaji. Mapitio yanajadili usanifu unaotegemea IFE katika mifumo ya carbon dots na graphene oxide quantum dot–AuNP.
Sensa za “Turn-on” na “turn-off” zinamaanisha nini?
Katika mfumo wa Turn-on, fluoresensi huongezeka baada ya lengo kufika. Kwa sababu ya usuli wa awali wa chini, mbinu hii inaweza kuwa na faida katika baadhi ya matumizi. Katika mfumo wa Turn-off, kufungamana kwa lengo hupunguza fluoresensi. Mielekeo yote miwili ya ishara inaweza kutumika kwa kipimo cha kiasi ikiwa kalibresheni sahihi na udhibiti wa matriksi vimehakikishwa.
Nanoparticles za dhahabu katika mifumo yenye lebo
Nanoparticles za dhahabu (AuNPs) zimetumika sana katika aptasensa za KANA kutokana na eneo kubwa la uso, adsorption ya DNA na uwezo mkubwa wa kuzima fluoresensi. Katika baadhi ya mifumo, aptamer yenye lebo ya FAM inapoadsorb kwenye uso wa AuNP fluoresensi huzimika; kufungamana kwa lengo kunapobadilisha muundo wa aptamer na kuiweka mbali na uso, fluoresensi hurudi.
Mapitio yanasisitiza kwamba utaratibu huu unapaswa kufasiriwa kwa tahadhari katika mazingira yenye protini nyingi kama maziwa halisi. Protini zinaweza kuunda “protein corona” kwenye AuNP na kubadilisha adsorption ya moja kwa moja ya ssDNA kwenye uso wa nanoparticle. Hali hii inaweza kufanya utaratibu unaofanya kazi katika buffer safi usifanye kazi kwa namna ileile katika maziwa au seramu isiyosindikwa.
Graphene na carbon nanotubes
Graphene na carbon nanotubes zinaweza kuadsorb DNA yenye mnyororo mmoja kupitia mwingiliano wa π–π na kuonyesha uwezo mkubwa wa kuzima. Mapitio yanatoa mfano wa jukwaa la UCNP–graphene FRET ambapo kukaribia kwa aptamer ya KANA-1 kwenye graphene huzimisha utoaji wa upconversion nanoparticle, na baada ya kufungamana kwa lengo aptamer inapojitenga, fluoresensi hurejea.
Katika mpangilio mwingine unaotegemea carbon nanotube, tofauti ya tabia ya adsorption ya ssDNA na dsDNA kwenye CNT ilitumika na 0,4 nM LOD ikaripotiwa katika uchanganuzi wa maziwa.
Kwa nini ukuzaji wa ishara hutumika?
Utambuzi wa molekuli moja ya KANA na aptamer unaweza kuzalisha mabadiliko madogo sana ya macho. Mifumo ya ukuzaji wa asidi ya nukleiki inalenga kubadilisha tukio hilo dogo la utambuzi kuwa bidhaa nyingi za DNA au mabadiliko mengi ya fluorophore.
| Kifupisho | Jina kamili | Kazi ya jumla | Gharama / kizuizi kikuu |
|---|---|---|---|
| CHA | Catalytic Hairpin Assembly | Kichochezi hufungua hairpin DNA zinazofuatana na kuzalisha ishara | Vipengele vingi vya DNA na athari zinazowezekana za leakage |
| HCR | Hybridization Chain Reaction | Uundaji wa mfululizo wa miundo mirefu ya DNA na uzalishaji wa maeneo mengi ya kufungamana kwa rangi | Athari ndefu zaidi na uboreshaji wa probe |
| RCA | Rolling Circle Amplification | Uzalishaji wa DNA ndefu inayojirudia kutoka kwenye template ya duara | Inahitaji enzyme na hali zinazofaa za athari |
| SDA | Strand Displacement Amplification | Kuongeza DNA inayohusiana na lengo kupitia uhamishaji wa mnyororo | Sehemu ya kienzaimatik na hitaji la uboreshaji |
| DNA walker | Mfumo wa DNA walker | Sehemu ya DNA iliyoamilishwa hushughulikia kwa mfululizo probe nyingi za uso | Utata wa usanifu na vipengele vingi vya athari |
Urejelezaji wa lengo unaosaidiwa na exonuclease
Katika mifumo inayotumia Exonuclease I au Exonuclease III, kufungamana kwa lengo kunaweza kuanzisha mmeng'enyo wa miundo maalumu ya DNA. Baada ya mmeng'enyo KANA inaweza kuachiliwa tena na kufungamana na molekuli mpya ya aptamer. Hivyo, molekuli moja lengwa inaweza kushiriki katika mizunguko mingi ya ishara.
Utaratibu huu unaweza kusaidia kuzalisha ishara yenye nguvu katika viwango vya chini sana vya analiti; hata hivyo, utendaji wa mwisho wa sensa unategemea udhibiti mkali wa shughuli ya enzyme, halijoto, pH, mfuatano wa DNA na muda wa athari.
Aptamer iliyogawanywa ni nini na kwa nini hutumiwa?
Aptamer iliyogawanywa ni usanifu ambapo aptamer yenye urefu kamili hugawanywa katika vipande viwili au zaidi vifupi vya asidi ya nukleiki vinavyofanya kazi pamoja wakati wa utambuzi wa lengo; lengo ni kupunguza kukunjika kusiko lazima na utata wa usanisi, kuongeza upatikanaji wa lengo na kubadilisha kuungana tena kwa vipande mbele ya lengo kuwa utaratibu wa moja kwa moja wa kutengeneza ishara.
Katika mapitio, mfuatano wa KANA-1 umegawanywa katika vipande viwili:
| Kipande | Mwelekeo wa mfuatano | Mfuatano |
|---|---|---|
| KANA-S1 | 5′→3′ | TGGGGGTTGAG |
| KANA-S2 | 5′→3′ | GCTAAGCCGA |
Mchakato wa kugawa si tu “kukata aptamer mara mbili”. Mahali pabaya pa kugawanya panaweza kuharibu mfuko wa kufungamana na lengo au kupunguza sana nishati ya kuungana tena kwa vipande. Mapitio yanasema maeneo laini ya loop au miunganiko ya stem–loop iliyo mbali na eneo kuu la kufungamana kwa lengo inaweza kutathminiwa kama maeneo yanayowezekana ya kukata, lakini hakuna kanuni ya jumla ya usanifu wa split-aptamer ambayo imepatikana hadi sasa.
Gharama ya thermodynamics ya kugawanya
Kukunjika kwa molekuli moja yenye urefu kamili si mchakato uleule wa thermodynamics na vipande viwili tofauti kukutana katika nafasi sahihi ndani ya suluhisho na kuungana tena. Kuungana kwa vipande viwili kunaweza kuleta gharama ya ziada ya entropy na hivyo kupunguza affinity ya ndani ikilinganishwa na aptamer yenye urefu kamili.
Kwa upande mwingine, vipande vikifanya kukunjika kusiko maalumu kwa kiwango kidogo vinapotengana, kuungana kwa uteuzi zaidi lengo linapofika na kupunguza ishara ya usuli kunaweza kutoa faida kwa umaalumu wa sensa. Kwa hiyo katika usanifu wa split aptamer, si Kd pekee bali pia usuli, kinetiki ya kuungana tena, mkusanyiko wa fragment na ustahimilivu wa matriksi halisi ya chakula vinapaswa kutathminiwa kwa pamoja.
Split aptamer + CuAAC
Moja ya mifano ya kwanza katika mapitio ni mfumo ambapo KANA-S1 na KANA-S2 huunganishwa kupitia mmenyuko wa cycloaddition ya azide–alkyne unaokatalizwa na copper(I) (CuAAC). Bila lengo, vipande viwili hubaki mbali. KANA inapokuwapo, kuungana kwa vipande karibu na lengo huleta vikundi tendaji vya azide na alkyne karibu na kuruhusu bidhaa ya triazole yenye fluoresensi kuundwa.
Split aptamer + DNA-AgNC + Exo I
Katika mfumo mwingine, KANA-S1, KANA-S2 na DNA inayokamilishana vimeunganishwa na fluoresensi ya DNA-templated silver nanocluster (DNA-AgNC). KANA inapokuwapo, mabadiliko katika muundo wa duplex huanzisha mmeng'enyo wa Exonuclease I na kupungua kwa ishara. Mapitio yanaripoti 1,07 nM LOD na muda wa uchanganuzi wa takriban dakika 45 kwa mfumo huu.
Split aptamer + G4/ThT
Mchanganyiko wa KANA-S1 na KANA-S1/S2 unaweza kuunda G-quadruplex (G4) kwa sababu ni tajiri kwa G na unaweza kutoa fluoresensi pamoja na Thioflavin T. Kufungamana kwa KANA kunapovuruga muundo wa G4, ThT hutengana na ishara hupungua. Mapitio yanaripoti 4,88 nM LOD kwa KANA-S1/ThT na 4,53 nM LOD kwa KANA-S1/S2/ThT.
Katika sampuli za maziwa zilizofanyiwa usindikaji wa awali na kuongezewa KANA, viwango vya recovery vya takriban %97,6–104,5 na %98,4–105,9 viliripotiwa kwa mifumo hii miwili. Matokeo haya ni uthibitishaji wa spike-recovery unaodhibitiwa; hayamaanishi kwamba utendaji huohuo umehakikishwa kwa kila sampuli ya maziwa iliyochafuliwa kiasili na ambayo haijasindikwa.
Ugunduzi wa antibiotiki nyingi kwa DNA tweezer
Mapitio pia yanajadili usanifu wa DNA tweezer wenye kazi mbili ambao unaweza kutambua KANA na enrofloxacin katika usanifu uleule. KANA-S1 na KANA-S2 zinapotambua lengo, muundo wa kibano cha DNA hufunga na umbali kati ya fluorophore na kizimaji hubadilika, hivyo fluoresensi hupungua.
Mbinu hii inavutia kwa uchunguzi wa mabaki mengi; hata hivyo, kuingiliana kwa sehemu kwa utoaji wa FAM na ROX kunaweza kusababisha signal cross-talk. Zaidi ya hayo, mwitikio wa kuvukiana dhidi ya antibiotiki zinazohusiana kimuundo unahitaji kupimwa kando katika sampuli halisi za chakula zenye mabaki mengi.
Kwa Nini Athari ya Matriki ya Chakula Hubadilisha Utendaji wa Aptasensa?
Athari ya matriki ya chakula ni hali ambapo protini na mafuta ya maziwa, viambajengo vya nyama, sukari, chumvi na ioni nyingine hubadilisha ufungamanaji wa aptamer, uso wa nanopartikeli au uzalishaji wa fluoresensi bila kutegemea mkusanyiko wa KANA; kwa hiyo LOD ya chini na uwiano mkubwa wa ishara-kwa-kelele unaopatikana katika suluhisho la bafa hauhifadhiwi moja kwa moja katika sampuli halisi ya chakula.
Tatizo la protein corona katika maziwa
Hasa katika sensa zinazotegemea AuNP, ni muhimu kwamba protini zinaweza kuadsorbi kwenye uso wa nanopartikeli na kuunda tabaka la protini. Aptamer inaweza sasa kuingiliana si moja kwa moja na uso wa dhahabu bali na mazingira haya mapya ya uso. Ikiwa uadsorpsheni wa aptamer na desorpsheni inayotegemea lengo ndiyo mekanizimu ya msingi ya sensa, hali hii inaweza kubadilisha mantiki ya ishara.
Ioni na G-quadruplex
Miundo ya G4 huathiriwa na ioni katika mazingira. Kwa hiyo, katika mifumo isiyo na lebo inayotumia G4/ThT au G4/NMM, maudhui ya asili ya ioni katika chakula yanaweza kubadilisha usawa wa kukunjika kwa G4 na fluoresensi ya rangi hata kama KANA lengwa haipo.
Kwa nini utayarishaji wa awali wa sampuli unaweza kuwa usioepukika?
| Mbinu | Faida kuu | Kizuizi kikuu |
|---|---|---|
| Uchanganyaji kwa kupunguza mkusanyiko | Ni ya haraka na rahisi; inaweza kupunguza athari za viambajengo vya matriki. | Pia inaweza kupunguza KANA hadi mkusanyiko wake ushuke chini ya LOD. |
| Uwekaji wa protini kama mashapo | Hupunguza protini na baadhi ya mwingiliano wa makromolekuli. | Inaweza kusababisha upotevu wa analiti na kuhitaji hatua za ziada za utenganishaji. |
| Uchimbaji wa awamu dhabiti (SPE) | Unaweza kutoa uboreshaji wa mkusanyiko pamoja na utakaso. | Unahitaji utaratibu tata zaidi na uboreshaji wa hali. |
| Utenganishaji wa sumaku | Unaweza kuunganisha utakaso na ukolezaji wa lengo katika muundo mmoja. | Unaweza kuhitaji vitendanishi zaidi na muda mrefu zaidi wa mchakato. |
| Centrifugation / filtration | Inaweza kupunguza mwingiliano wa mashapo, mafuta au chembechembe. | Peke yake haiondoi athari zote za kikemia za matriki. |
Hitimisho la wazi la mapitio ni kwamba hakuna itifaki moja ya ulimwengu mzima ya utayarishaji wa awali kwa aina zote za chakula. Mekanizimu ya sensa, masafa ya mkusanyiko wa lengo na matriki ya chakula lazima yatathminiwe kwa pamoja.
Asilimia ya urejeshaji inaeleza nini?
Tafiti nyingi za sensa katika mapitio zinaripoti majaribio ya urejeshaji katika sampuli za maziwa, asali, samaki au nyama zilizoongezewa kiasi kinachojulikana cha KANA. Urejeshaji hutathmini ni kiasi gani cha analiti kilichoongezwa kinaweza kupimwa mwishoni mwa uchanganuzi.
Chanzo hakitoi mlinganyo mmoja wa pamoja wa urejeshaji. Kwa majaribio ya spike-recovery, usemi wa kawaida wa kufundishia ni huu:
\[ \mathrm{Recovery}(\%)= \frac{C_{\mathrm{spike\ sonrası}}-C_{\mathrm{başlangıç}}} {C_{\mathrm{eklenen}}} \times100 \]
Urejeshaji wa takriban %100 unapendekeza kwamba sehemu kubwa ya kiasi kilichoongezwa imepimwa kwa usahihi. Matokeo yaliyo juu kidogo ya %100 yanaweza pia kutokea kutokana na kutokuwa na uhakika wa majaribio, kalibrasheni au athari ya matriki. Urejeshaji mzuri peke yake hauthibitishi kwamba sensa ni sahihi kama mbinu ya marejeo ya udhibiti katika sampuli zote halisi za uwanjani.
RSD hupima nini?
Relative Standard Deviation (RSD) huonyesha mtawanyiko wa jamaa wa vipimo vinavyorudiwa ikilinganishwa na wastani. Chanzo hakitoi fomula moja ya RSD; ufafanuzi wa kawaida wa kufundishia ni:
\[ \mathrm{RSD}(\%)=\frac{s}{\bar{x}}\times100 \]
Hapa \(s\) ni mkengeuko sanifu na \(\bar{x}\) ni wastani wa vipimo vinavyorudiwa. RSD ya chini huashiria utofauti mdogo wa kipimo kwa jamaa katika hali husika za majaribio; hata hivyo, RSD ya chini ndani ya maabara haithibitishi moja kwa moja urudiwaji wa muda mrefu kati ya loti tofauti za uzalishaji, vifaa na matriki za chakula.
Mbinu na Matokeo ya Utafiti
Utafiti huu haufanyi jaribio jipya. Wang na Qiu wanakusanya aptamer za KANA zilizochapishwa na tafiti za aptasensa za fluoresensi na kuzilinganisha kwa ukosoaji kwa kuzingatia mikakati ya uteuzi, sifa za ufungamanaji, LOD, masafa ya mstari, hali za uchanganuzi, matriki ya chakula, utayarishaji wa awali wa sampuli, urejeshaji, RSD na mekanizimu ya sensa.
Chanzo hakiripoti mchoro wa mtiririko wa PRISMA, itifaki ya mapitio ya kimfumo iliyosajiliwa mapema, misururu ya kina ya utafutaji wa hifadhidata au mbinu ya meta-analysis. Kwa hiyo, kazi hii haijaainishwa katika Verianla kama mapitio rasmi ya kimfumo au meta-analysis.
Jedwali 2 linapaswa kusomwaje?
Jedwali pana zaidi la data katika mapitio linalinganisha sensa mbalimbali za KANA za fluoresensi. Hata hivyo, safu zake zinatoka katika maabara tofauti, aptamer tofauti, matriki tofauti za chakula, pH tofauti, halijoto, muda wa mmenyuko, utayarishaji wa awali na usanifu tofauti wa amplifikasheni.
Kwa hiyo, upangaji wa upande mmoja wa aina “safu yenye LOD ndogo zaidi ndiyo sensa bora zaidi” si sahihi kisayansi.
| Aptamer / mkakati | LOD | Matriki ya sampuli | Maana ya kisayansi |
|---|---|---|---|
| KANA-1 / AuNPs-FAM | 0,3 nM | Maziwa | Uzimizaji kwa nanopartikeli na urejeshaji wa fluoresensi unaotegemea lengo |
| KANA-1 / optimize AuNPs-FAM | 0,0001 nM | Maji ya mto, maji ya ziwa, maziwa | LOD ya uchanganuzi ya chini sana; si sawa na afiniti intrinsiki ya KANA-1 katika suluhisho. |
| KANA-1 / UCNP-graphene | 0,018 nM | Seramu ya binadamu | Uzimizaji/urejeshaji unaotegemea UC-FRET |
| KANA-1 / CNT-FAM | 0,4 nM | Maziwa | Hutumia tofauti ya uadsorpsheni wa ssDNA/dsDNA kwenye CNT. |
| KANA-1 / Exo I–2-AP–µPAD | 1,26 × 10−5 nM | Maziwa, asali | Urejelezaji wa lengo kwa enzimu na mfumo wa microfluidic wa karatasi |
| KANA-1 / HCR–SG I | 9,29 × 10−4 nM | Maziwa, samaki, nyama ya nguruwe | Uzalishaji wa dsDNA ndefu kwa HCR na amplifikasheni ya ishara ya SG I |
| KANA-1 / AgNC | 0,18 nM | Maziwa | Fluoresensi ya nanocluster ya metali iliyotengenezwa kwa kiolezo cha DNA |
| KANA-1 / HCA-AgNC | 1,35 × 10−5 nM | Maziwa | Mchanganyiko wa nanocluster na amplifikasheni |
| KANA-1 / AuNC-MnO2 | 1,2 × 10−3 nM | Maziwa | Fluoresensi + hali mbili ya kuona na amplifikasheni |
| KANA-S1/S2 / DNA-AgNC–Exo I | 1,07 nM | Nyama ya chaza, maji ya bahari, maji ya ziwa, maziwa | Aptamer iliyogawanywa + amplifikasheni ya kienzimu |
| KANA-S1/S2 / ThT-G4 | 4,53 nM | Maziwa | Uhamisho wa fluoresensi wa G4/ThT wa aptamer iliyogawanywa |
| KANA-S1/S2 / DNA tweezer-FAM | 743,03 nM | Maziwa, kuku | Nanomashine ya DNA inayofaa kwa ugunduzi wa antibiotiki nyingi |
| KANA-3 / RGO-FAM | 0,001 nM | Seramu ya damu, maziwa | Ugunduzi wa fluoresensi unaotegemea graphene kwa aptamer isiyo KANA-1 |
| KANA-4 / pH-directed ThT | 100 nM | Seramu ya binadamu, maji ya ziwa | Ufungamanaji ni nyeti kwa pH. |
| KANA-5 / strand-displacement FAM | 900 nM | Seramu ya binadamu | Mfano muhimu unaoonyesha kuwa afiniti kubwa ya ITC haimaanishi moja kwa moja LOD ya chini zaidi ya sensa |
Jedwali hili linaweka wazi somo kuu la kimawazo la mapitio: LOD ya KANA-5, ambayo hufungamana kwa nguvu kwa ITC, katika muundo mmoja wa sensa inaweza kuwa juu sana kuliko LOD za majukwaa ya KANA-1 yanayotumia amplifikasheni kubwa. Unyeti wa sensa na afiniti ya ufungamanaji wa molekuli ni tabaka tofauti.
Mwelekeo wa kiasi wa majukwaa yenye lebo
Mapitio yanaeleza kuwa katika mifumo yenye lebo inayotegemea AuNP bila amplifikasheni, thamani za LOD zimeripotiwa katika masafa mapana sana ya takriban 0,0001–71,53 nM. Upana huu unaonyesha kwamba ukubwa wa nanopartikeli, kemia ya uso, msongamano wa aptamer, ioni za mazingira na mpangilio wa usomaji vinaweza kuathiri utendaji kwa kiasi kikubwa.
Mifumo inayotegemea graphene na CNT imetolewa mifano katika masafa membamba zaidi, na LOD za takriban 0,018–0,4 nM zimeripotiwa. Mfumo wa UCNP–graphene FRET ni mojawapo ya mifano iliyofikia 0,018 nM bila amplifikasheni ya ziada ya asidi ya nukleiki.
Mifumo inayosaidiwa na enzimu na yenye amplifikasheni ya asidi ya nukleiki inaweza kufikia LOD za chini zaidi; kwa upande mwingine, idadi ya viambajengo vya mmenyuko, muda na utata wa uboreshaji huongezeka.
Mwelekeo wa kiasi wa majukwaa yasiyo na lebo
Katika mifumo ya rangi ya G4/intercalator, mapitio yanaripoti thamani za LOD za takriban 0,3–59 nM. Utendaji wa majukwaa haya hautegemei lengo pekee bali pia sifa za rangi inayotumiwa, topolojia ya G4 na ioni za mazingira.
Katika mifumo ya IFE inayotegemea carbon dots na graphene oxide quantum dots, LOD za takriban 3,6–18 nM zimeripotiwa. Mifumo hii hutoa faida za urahisi wa maandalizi na photostability, lakini unyeti wa uchanganuzi unaweza kuwa mdogo zaidi wakati hakuna amplifikasheni kubwa.
Katika mifumo ya nanocluster za metali, LOD za takriban 1,2 × 10−3–22,6 nM zimeripotiwa; viwango vya chini zaidi vimefikiwa kwa amplifikasheni kama RCA au DNA walker. Miundo ya ratiometric inaweza kufidia kwa sehemu mkengeuko wa ishara unaosababishwa na matriki kwa kutumia njia ya pili ya fluoresensi kama rejea ya ndani.
Kwa nini fluoresensi ya ratiometric ni muhimu?
Katika kipimo cha fluoresensi cha njia moja, chanzo cha mwanga, kiasi cha probe, unyeti wa kifaa au mabadiliko ya matriki yanaweza kubadilisha ishara bila kutegemea lengo. Mfumo wa ratiometric hutumia uwiano kati ya njia nyeti kwa lengo na njia ya rejea iliyo thabiti zaidi. Urekebishaji huu wa ndani unaweza kupunguza mkengeuko wa ishara ingawa hauondoi mwingiliano wote.
Uthibitishaji wa sampuli halisi unaoangaziwa katika chanzo
Katika baadhi ya tafiti za maziwa zinazotegemea AuNP, urejeshaji wa takriban %96–105 na thamani za RSD za tarakimu moja za chini zimeripotiwa. Katika uchanganuzi wa maziwa unaotegemea CNT, urejeshaji wa %98,5–103 na RSD ya takriban %3,81–4,67 iliripotiwa. Katika mbinu ya HCR/SG I, urejeshaji wa %90,2–114,0 na RSD ya takriban %1,13–3,25 kwa maziwa, samaki na nyama ya nguruwe uliripotiwa.
Kwa kuwa thamani hizi zinatoka katika tafiti tofauti, hazipaswi kuunganishwa kana kwamba ni matoleo tofauti ya sensa moja. Urejeshaji ulio karibu na %100 unapendekeza kwamba usahihi unaweza kuwa mzuri katika majaribio ya kuongeza kiasi kinachojulikana kwa udhibiti; lakini si ushahidi wa utendaji sawa na mbinu ya udhibiti katika sampuli halisi za soko.
Utegemezi wa KANA-4 kwa pH
KANA-4 ni aptamer iliyochaguliwa chini ya hali zenye asidi kidogo. Mapitio yanaripoti Kd ya takriban 0,32 µM kwa ITC, na yanaeleza kwamba afiniti hudhoofika pH inapoongezeka na inaweza kushuka hadi kiwango cha takriban 2 µM karibu na pH 7,5.
Matokeo haya yanaonyesha kwamba mtazamo wa “Kd ya aptamer ni nambari ya utambulisho isiyobadilika” si sahihi. Usawa wa ufungamanaji hutegemea hali kama bafa na pH.
Kwa nini KANA-5 ni muhimu?
KANA-5 ilitambuliwa kwa kuchunguza upya mfuatano wenye wingi mdogo katika jaribio la Capture-SELEX ambao hapo awali ulikuwa umepuuzwa kwa sababu ya urutubishaji mdogo wa mfuatano. ITC ilionyesha Kd ya 51 ± 5 nM katika pH 7,5. Uchambuzi wa nuclear magnetic resonance (NMR) ulionyesha kwamba aptamer hukunjika na kutengeneza mfuko wa ufungamanaji wa pande tatu uliofafanuliwa vizuri zaidi ligand inapofungamana.
Hali hii ni muhimu zaidi kuliko kutoa tu Kd ndogo ya nambari; inatoa taarifa huru kuhusu msingi wa kimuundo wa ufungamanaji. Hata hivyo, ukweli kwamba KANA-5 huonyesha kiwango fulani cha ufungamanaji mtambuka na tobramycin pia unakumbusha kwamba afiniti kubwa haimaanishi uteuzi kamili.
Kwa nini uteuzi si tu kusema “ilipimwa dhidi ya antibiotiki nyingine”?
Aminoglycosides zinaweza kushiriki motifu za kikemia zinazofanana. Mapitio yanaeleza kwamba sensa nyingi za KANA zimefanyiwa vidhibiti kwa antibiotiki zisizohusiana kimuundo, ilhali vipimo vya kimfumo vya cross-reactivity dhidi ya aminoglycosides nyingine vimekuwa vichache zaidi.
Tathmini halisi ya uteuzi inapaswa kufanywa si tu kwa molekuli tofauti sana kama penicillin au tetracycline, bali pia kwa analogi za aminoglycoside zilizo karibu kikemia na KANA.
Simu mahiri na usomaji unaobebeka
Mapitio yanatathmini vifaa vya microfluidic vya karatasi, fluorometers za mkononi na upigaji picha wa fluoresensi unaotegemea simu mahiri kama njia zinazowezekana kwa matumizi ya uwanjani. Kamera ya simu inaweza kutoa faida za gharama ndogo na upatikanaji; hata hivyo, utofauti kati ya modeli za kamera, mwanga wa mazingira na algoriti za uchakataji wa picha unaweza kuathiri urudiwaji wa kiasi.
Kwa hiyo, kauli “inaweza kupigwa picha kwa simu” peke yake haimaanishi kwamba kifaa cha kubebeka chenye usahihi wa kiwango cha udhibiti kimepatikana.
Machine learning inashughulikiwa katika nafasi gani katika mapitio?
Machine learning si kiambajengo cha sensa kilichojaribiwa kwa majaribio katika makala hii; kinajadiliwa katika sehemu ya hitimisho na mitazamo ya baadaye kama mbinu ya baadaye ya uchakataji wa ishara. Uwezo wa kutenganisha vizuri zaidi mandharinyuma yanayotokana na matriki na ishara ya lengo kwa kutumia alama za vidole za fluoresensi zenye vipimo vingi, ishara za ratiometric au data za excitation–emission matrix unajadiliwa.
Mapitio pia yanasisitiza umuhimu wa usanifishaji wa upataji wa data, seti wakilishi za data za mafunzo, uwezo wa kuhamisha modeli kati ya matriki tofauti za chakula, na algoriti nyepesi zinazoweza kufasiriwa na kufanya kazi kwenye vifaa vinavyobebeka. Kwa hiyo, machine learning si suluhisho lililothibitishwa linalotatua tatizo la sasa la matriki moja kwa moja, bali ni mwelekeo wa ziada unaohitaji kuchunguzwa.
Kwa nini nafasi za LC-MS/MS na aptasensa ni tofauti?
Mapitio yanatathmini LC-MS/MS kama mbinu ya marejeo kwa uchanganuzi sahihi wa kiasi wa mabaki ya antibiotiki na kipimo cha analiti nyingi. Faida kuu za aptasensa za fluoresensi ni mahitaji ya chini ya vifaa, muda mfupi wa uchanganuzi na uwezekano wa kubebeka.
Kwa hiyo, modeli inayowezekana ya matumizi ya baadaye si lazima iwe tu “sensa badala ya LC-MS/MS”. Mbinu za ngazi mbalimbali, ambapo uchunguzi wa haraka wa uwanjani unafanywa kwa aptasensa na sampuli zinazohitaji uthibitishaji zinatumwa kwa mbinu ya maabara ya marejeo, zinaweza kuwa halisi zaidi kiteknolojia. Hata hivyo, sentensi hii ya mwisho si matokeo ya utafiti bali ni hitimisho la kueleza katika kiwango cha matumizi linalotokana na tofauti za utendaji zilizoonyeshwa na mapitio.
Nguvu za mapitio
Utafiti hautoi tu orodha ya LOD. Unajadili kwa pamoja mbinu ya uteuzi wa aptamer, mbinu ya uthibitishaji, mekanizimu ya ubadilishaji wa ishara, utayarishaji wa awali wa sampuli halisi, athari ya matriki, usanifu wa amplifikasheni na matatizo ya matumizi ya uwanjani.
Hasa, kuchunguza mjadala wa muda mrefu kuhusu ufungamanaji wa KANA-1 pamoja na jedwali la utendaji wa sensa kunazuia tafsiri rahisi kwamba “sensa nyeti sana = aptamer nzuri sana”.
Vizuizi vikuu vya mapitio na uga huu
Chanzo kinaonyesha kwamba hali za majaribio katika tafiti tofauti za sensa hazijasanifishwa. Kwa kuwa pH, halijoto, muda wa incubation, utayarishaji wa sampuli na matriki hutofautiana, upangaji wa moja kwa moja wa LOD una mipaka.
Uwezo mahususi wa KANA-1 kufungamana katika suluhisho haujatatuliwa kikamilifu. Licha ya hilo, sehemu kubwa ya sensa katika fasihi hutumia KANA-1.
Tafiti nyingi zimethibitishwa kwa sampuli zilizoongezewa analiti; uthibitishaji kwa uchafuzi wa asili na sampuli pana za soko halisi ni mdogo zaidi.
Urudiwaji wa uzalishaji wa sensa kati ya loti na uthabiti wa muda mrefu haujaripotiwa kwa utaratibu katika majukwaa mengi.
Kemia ya uso ya nanomaterials na hasa uundaji wa nanocluster za metali unaweza kusababisha utofauti kati ya loti za uzalishaji.
Hakuna utayarishaji mmoja wa sampuli unaotumika kwa ulimwengu mzima kwa vyakula tofauti.
Kwa kukubalika na wadhibiti, kazi ya ziada inahitajika kuhusu kalibrasheni, udhibiti wa ubora, ulinganisho na mbinu za marejeo na uthibitishaji wa vituo vingi.
Hitimisho zinazoungwa mkono na utafiti
- Majukwaa ya fluoresensi yanayotegemea aptamer yanawezesha usanifu mbalimbali wa sensa unaoweza kufikia vikomo vya chini sana vya uchanganuzi vya kugundua KANA.
- Kd na LOD ni dhana tofauti za kimwili na kiuchanganuzi na haziwezi kutumiwa kwa kubadilishana.
- Ingawa KANA-1 imetumiwa katika sensa nyingi, kuna kutokuwa na uhakika muhimu wa uthibitishaji kuhusu ufungamanaji wake mahususi katika suluhisho.
- KANA-5 ni mojawapo ya wagombea wa kizazi kipya wenye uthibitishaji wenye nguvu zaidi wa kimuundo/thermodynamic kwa ITC na NMR.
- Mifumo yenye lebo na isiyo na lebo ina wasifu tofauti wa gharama, utata, unyeti na uvumilivu wa matriki.
- Amplifikasheni ya ishara inaweza kupunguza LOD kwa kiasi kikubwa lakini inaweza kufanya mbinu kuwa tata zaidi na nyeti zaidi kwa ishara ya mandharinyuma.
- Aptamer zilizogawanywa zinaweza kutoa faida za urahisi wa kimuundo na kuungana tena kunakotegemea lengo; hata hivyo, uthibitishaji huru wa ufungamanaji bado unahitajika.
- Matriki ya chakula na utayarishaji wa awali wa sampuli ni viambajengo vya msingi vya utendaji halisi wa uchanganuzi.
- Aptasensa za fluoresensi zina matumaini kwa uchunguzi wa uwanjani, lakini kwa ujumla bado hazijachukua nafasi ya LC-MS/MS katika uthibitishaji wa kiasi wa udhibiti.
Hitimisho ambazo utafiti hauungi mkono
Mapitio hayaonyeshi kwamba sensa zote za KANA-1 hufanya kazi kimakosa. Tatizo linalojadiliwa ni kwamba haijathibitishwa vya kutosha katika kila jukwaa ni kwa kiwango gani ishara ya uchanganuzi inayozingatiwa inategemea ufungamanaji mahususi wa KANA–aptamer.
Utafiti hauainishi “sensa bora zaidi ya KANA” moja. Mfumo wenye LOD ya chini zaidi huenda usiwe kwa wakati mmoja na uteuzi wa juu zaidi, muda mfupi zaidi, utayarishaji rahisi zaidi wa awali, urudiwaji wa juu zaidi au utendaji bora zaidi katika chakula halisi.
Thamani nzuri za urejeshaji katika sampuli za maziwa, samaki, nyama au asali zilizoongezewa analiti hazihakikishi usahihi uleule kwa sampuli zote za chakula zenye uchafuzi wa asili.
Mapitio hayaonyeshi kwamba aptasensa za fluoresensi tayari zimebadilisha kabisa mbinu za sasa za maabara za udhibiti au kwamba tatizo la kufanya biashara limetatuliwa.
Hayathibitishi kwamba machine learning imetatua athari ya matriki; yanaijadili kama mojawapo ya njia za uchakataji wa ishara zinazohitaji kuchunguzwa siku zijazo.
Mahitaji yanayoangaziwa na chanzo kwa utafiti wa baadaye
Mapitio yanaeleza kwamba utafiti wa baadaye unahitaji hasa aptamer zenye afiniti kubwa zilizothibitishwa kwa uhuru katika suluhisho, vipimo vya kimfumo vya uteuzi dhidi ya aminoglycosides, uthibitishaji uliosanifishwa katika matriki mbalimbali halisi za chakula, udhibiti wa uzalishaji kati ya loti, tafiti za uthabiti wa muda mrefu na mbinu rahisi zaidi za utayarishaji wa sampuli.
Fluorometers zinazobebeka, majukwaa ya karatasi na usomaji kwa simu mahiri vinaweza kurahisisha matumizi ya uwanjani. Hata hivyo, bila kalibrasheni kati ya vifaa na usanifishaji wa kipimo, kubebeka peke yake hakuhakikishi utegemevu wa kiasi.
Kwa mpito kwenda matumizi ya viwandani na ya udhibiti, michakato sanifu ya uzalishaji, vigezo vya udhibiti wa ubora, itifaki za uthabiti na seti pana za data za uthibitishaji zinazojumuisha matriki tofauti za chakula zinahitajika.
Dokezo la Chanzo na Mbinu
Kichwa asili: Aptamer-Based Fluorescent Biosensors for Kanamycin Detection in Food Systems: Design Strategies, Sensing Mechanisms, and Practical Applications.
Waandishi: Shijing Wang; Jieqiong Qiu.
Mwandishi wa mawasiliano: Jieqiong Qiu.
Mchango sawa: Chanzo hakina tamko la mchango sawa au uandishi mwenza wa kwanza.
Taasisi: College of Life Sciences and Medicine, Zhejiang Sci-Tech University, Hangzhou 310018, China.
Jarida: Foods.
Mchapishaji: MDPI, Basel, Switzerland.
Juzuu / toleo / nambari ya makala: 15(15), 2758.
DOI: 10.3390/foods15152758.
Rekodi rasmi ya uchapishaji: Ukurasa wa makala wa MDPI Foods; unapatikana kupitia DOI.
Tarehe ya kuwasilishwa: 29 Juni 2026.
Tarehe ya marekebisho: 30 Julai 2026.
Tarehe ya kukubaliwa: 2 Agosti 2026.
Tarehe ya kuchapishwa: 5 Agosti 2026.
Mhariri wa kitaaluma: Seyed-Ahmad Shahidi.
Aina ya chanzo: Review. Utafiti si jaribio jipya la maabara wala meta-analysis.
Hali ya mapitio ya rika: Foods ni jarida la kimataifa la sayansi ya chakula linalopitiwa na rika na kuchapishwa na MDPI. Ripoti binafsi za wakaguzi hazikuchunguzwa katika tathmini hii.
Leseni: Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0).
Michango ya waandishi: Uundaji wa dhana S.W. na J.Q.; utafutaji wa fasihi na uchambuzi, rasimu asili, mbinu na utafiti S.W.; uwasilishaji wa picha S.W. na J.Q.; rasilimali, mapitio/uhariri, usimamizi, usimamizi wa mradi na upatikanaji wa ufadhili viliripotiwa kufanywa na J.Q.
Ufadhili: Foundation of Zhejiang Sci-Tech University, China; Grant No. 23042137-Y.
Kamati ya maadili: Haitumiki; utafiti huu si utafiti unaohusisha jaribio jipya kwa binadamu au wanyama.
Ridhaa yenye taarifa: Haitumiki.
Upatikanaji wa data: Waandishi wamesema kwamba hakuna data mpya iliyotengenezwa au kuchanganuliwa katika mapitio haya na kwa hiyo kushiriki data hakutumiki.
Mgongano wa maslahi: Waandishi waliripoti kutokuwa na maslahi ya kifedha yanayojulikana au uhusiano binafsi unaoweza kuathiri utafiti.
Muundo mkuu wa chanzo: Mapitio yanalinganisha aptamer za KANA, mbinu za fluoresensi zenye lebo, mbinu zisizo na lebo, matumizi ya split-aptamer, matriki halisi za chakula na matumizi ya baadaye ya uwanjani.
Kizuizi kikuu cha kimbinu: Utendaji wa sensa unaolinganishwa unatoka katika vyanzo visivyo na ulinganifu. Thamani tofauti za LOD hazikupatikana chini ya hali zilezile za majaribio au katika matriki ileile ya chakula. Kwa hiyo, upangaji wa utendaji wa nambari haupaswi kufasiriwa kuwa ubora wa jumla wa mbinu.
Dokezo la uthibitishaji wa KANA-1: Kd inayoonekana ya 78,8 nM katika utafiti wa awali wa lengo lililoimmobilishwa haikuthibitishwa kwa namna ileile katika uchanganuzi wa baadaye wa ITC katika suluhisho. Mapitio yanatathmini jambo hili kuwa mojawapo ya matatizo makuu ambayo hayajatatuliwa katika uga huu.
Mbinu ya vielelezo: Chanzo kina familia tisa za vielelezo zinazojumuisha miundo ya sekondari ya aptamer, AuNP, graphene/CNT, amplifikasheni, rangi ya G4, nanocluster za metali na mekanizimu za split-aptamer. Katika maudhui ya Verianla, muundo wa pikseli wa vielelezo vya chanzo haujanakiliwa; mahusiano ya msingi ya kisayansi yameelezwa upya kwa michoro asili ya SVG isiyo na skeli.
Dokezo la fomula: Makala chanzo hutumia dhana kama Kd, LOD, recovery, RSD na FRET lakini haitoi milinganyo yake ya jumla ya kihisabati kama fomula.
Acha maoni
Anwani yako ya barua pepe haitachapishwa. Sehemu za lazima zimewekewa alama ya *